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《中国汉族人群megsin基因变异与部分多态性位点鉴定论文》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、中国汉族人群Megsin基因变异与部分多态性位点鉴定论文夏运风，李幼姬,黄霜，黄伟俊，薛超，杨念生，黎嘉能，PatrickHMaxepolymorphismlociofMegsingeneinChineseHanpopulationXIAYunFeng,LIYouJi,HUANGShuang,HUANGaxentofNephrology,FirstAffiliatedHospital,2DepartmentofMedicalGeics,SunYatsenUniversity,.freelentofInternalMedicine,QueenMarryHos
2、pital,UniversityofHongKong,HongKong,China,4DepartmentofMedicine,HammersmithHospital,ImperialCollege,London,UK【Abstract】AIM:ToinvestigatethegenovariationofMegsininChineseHanpopulationandtoidentifysomesinglenucleotidepolymorphism(SNP)suitablefortheassociationstudyinIgAnephropathy(Ig
3、AN).METHODS:SNPsofMegsingenedifferentfunctionalregionsaccordingtoGenBank.TheirgenotypesinIgANpatientsandnormalcontrolsinedbypolymerasechainreactionrestrictionfragmentlengthpolymorphism(PCRRFLP)anddirectsequencing.HeterozygosityofeachSNPalcontrols.RESULTS:Inthe12SNPschosenfromGenBa
4、nk,6edorphismand6orphism.Torethan10%,butnostatisticaldifferencealcontrols（P0.05）.CONCLUSION:ThereismuchdifferenceingenovariationofMegsinbetaybeassociatedegsin;variation(geics);glomerulonephritis,IgA;Hannationality;China;polymorphism,singlenucleotide【摘要】目的：了解中国汉族人群Megsin基因变异.freelo
5、rthysm,SNP）位点，为最终阐明Megsin基因在IgA肾病发生、发展中的作用提供依据.1对象和方法1.1对象中国汉族IgA肾病患者471例均系我院及香港大学玛丽医院(1997～2004)收治的住院或门诊患者，其中男193例，女278例，均符合egsin基因序列及SNP信息（bioinfo.ann.ac.il,GenBankIDAF027866），在Megsin基因7个内含子和唯一一个在基因库中显示有SNP位点的外显子（第8外显子）中挑选12个要筛选的位点，随机选取IgA肾病和正常对照标本各50份，应用聚合酶链式反应限制性片段长度多态性（polyme
6、rasechainreactionrestrictionfragmentlengthpolymorphism,PCRRFLP）和直接测序的方法对各位点的基因型进行鉴定.PCR反应的条件及反应混合物中各成分的浓度，根据位点和引物的不同进行适当调整，各位点所用引物及限制性内切酶（见表1）.实验中用于测序的上下游引物分别为5′GGGCCTAGAAAGTGCTGGACACA3′和5′CAAGACACGTTTGGTGGTGTTTCA3′，其PCR产物长521bp,测序步骤如下：纯化的DNA模板20ng,BigDyeTerminatorCycleSequencingR
7、eadyReactionKitmix(AppliedBiosystems,美国)2μL，测序引物（同PCR引物）10μmol/L组成8μL反应体系进行PCR测序.反应条件：98℃1min,96℃30s,50℃30s,60℃4min，25个循环.3mol/L乙酸钠（pH5.2）和无水乙醇沉淀扩增的DNA，再用750mL/L的乙醇洗涤1次，然后加入18μL模板变性剂.测序模板在95℃水浴5min，立即置于冰水中5min将其淬灭成单链，转移至测序管，在ABI3100全自动序列分析仪上进行毛细管电泳测序.表1Megsin基因各SNP位点鉴定所用引物和限制性内切酶（
8、略）统计学处理:应用SPSS13.0软件做统计分析，组间杂合度的比
