中国汉族人群17个心血管疾病易感基因位点基因型和基因频率分析论文

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1、中国汉族人群17个心血管疾病易感基因位点基因型和基因频率分析论文【摘要】目的:调查中国汉族人群中17个心血管疾病易感基因位点的基因型和基因频率.方法:运用基因芯片技术同时检测138例来自中国大部分省市的汉族人的13个心血管易感基因的17个SNPs.结果:国内未曾见报道的4个基因位点基因型频率分别为：ET2985AA∶AG∶GG为2.2%(3)∶22.2%(30)∶75.6%(102)；NPRC(-55)AA∶AC∶CC为8.1%(11)∶23.0%(31)∶68.9%(93)；KQ1140则只发现了SS基因

2、型；CYP46rs754203CC∶CT∶TT为55.0％(66)∶20.0%(24)∶25.0%(30).ApoBMsp1+∶-为92％（232）∶8％（20），而Hapmap公布的则为100％（90）∶0％（0），两者比较，差异有统计学意义（χ2=7.587，P=0.000）.MTHFR677C∶T为70％（168）∶30％（72），与Hapmap中中国北京汉族人（CHB）公布的结果48.9％（44）∶51.1％（46），以及ALFRED中公布的中国香港汉族（SA0008510）77.8％（322）∶22

3、.2％（92）比较，差异具有统计学意义（χ2和P分别为12.70.freelap计划中CHB（ANP2238,ApoBXbaⅠ,NOS3298,ApoBEcorⅠ和ApoE112）和ALFRED网站的SA0008510的基因频率（AGT235,ACEAlu,ApoCⅢ3175,ApoCⅢ3206,ApoE158和SerpinA3rs4934）有较好的吻合.结论：SNPs频率分布具有种族和地区差异，中国汉族人群中ANP2238C,ApoBEcorⅠ（-）和KQ1140G,是少见的等位基因（5%)，可能不是心血管

4、疾病的主要原因.用基因芯片检测多个心血管疾病易感基因SNPs结果可靠.【关键词】血管疾病易感基因单核苷酸多态性寡核苷酸序列分析0引言目前的研究普遍认为原发性高血压、动脉粥样硬化、冠状动脉心脏病及脑血管意外等心血管疾病是多因素疾病，是由位于多个易感基因中的多个SNPs微效作用累加，与环境因素相互作用而发病.不同的SNPs的不同组合，使不同人群具有不同的心血管疾病易患性、导致相应疾病的临床表现各异，治疗效果不同.因此，对心血管疾病候选基因SNPs的研究是目前心血管疾病研究的热点，研究结果可用于对相关疾病的辅助诊断

5、、治疗方法的选择和预后的估计，更重要的是可以进行易患风险的预测，从而利于疾病的预防.但是SNPs在不同人群的分布的基因频率有很大的差异，具有种族和地区特色，因此针对不同人群SNPs研究应首先了解SNPs的频率分布情况，挑选该人群中具有一定基因频率的SNPs进行.本研究我们利用基因芯片技术调查分析中国汉族人群中13个心脑血管疾病相关基因［1-6］的17个SNPs的基因型和基因频率，以了解其在中国汉族人群中的分布特点.1对象和方法1.1对象均来自200504/200609在广东省深圳市人民医院门诊常规体检者，

6、经有关检查除外原发性高血压、冠心病等心血管疾病138(男90，女48)例，平均年龄50.3±10.5岁.调查对象均为彼此之间无血缘关系汉族，原籍分布中国大部分省份.1.2方法1.2.1标本采集和检测取外周血3mL,终浓度为2g/L的EDTA抗凝，上下颠倒数次混匀，存放于-20℃备用.DNA抽提后，用针对每个SNPs的引物分别进行PCR扩增，混合的PCR产物与基因芯片杂交、显色，最后检测荧光.DNA抽提、PCR扩增、杂交、显色及检测等步骤都严格按照上海百傲公司的Baio基因型检测芯片试剂盒使用说明书进行，芯片用

7、BaiO基因芯片识读仪检测，检测图像经ArrayDoctor软件分析.1.2.2质量控制对基因芯片检测的准确性，用DNA测序的方法进行了验证，准确率97.8％.在每次检测中都设置阴性、阳性对照品.样本检测过程中，若软件对“标志列”、“阴性对照”、“阳性对照”三者进行判断后，输出其中之一为“不合格“，则实验无效.同时随机抽取一份DNA样品，对其中一些SNP位点进行DNA测序以验证芯片检测准确性.统计学处理：所有资料均以SPSS11.5软件包分析.基因型和基因频率采用基因计数法计算，调查对象与HardyTHFR

8、，KQ1，CYP46A1，SerpinA3等13个基因中17个国内外报道与心血管疾病相关的SNPs.随机抽取样品进行的DNA测序验证该芯片检测准确性，两者结果吻合（图1，2）.2.2基因型检测结果显示在所调查中国汉族人群中，17个SNPs位点的基因型分布大都符合Hardysp1+∶-为92％（232）∶8％（20）；而Hapmap公布的则为100％（90）∶0％（0）；两者比较，差异有统计学意义（