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《鼻气管鸟杆菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第36卷第2期中国预防兽医学报Vo1.36.No.22014年2月ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicineFeb.2014doi:10.3969~.issn.1008-0589.2014.02.09鼻气管鸟杆菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立李富祥,段志华,赵文华,信爱国,杨仕标,李华春(1.云南省畜牧兽医科学院,云南昆明650224;2保山市动物疾病预防控制中心,云南保山678000)摘要:为建立鼻气管鸟杆菌(ORT)TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据ORT16SrRNA基因的保守序列设计特异性引物和TaqMan探针,通
2、过优化反应条件、特异性、敏感性、重复性试验和临床样品的检测,建立了ORTTaqMan荧光定量PCR检测方法。实验结果表明:该方法具有良好特异性;最低可以检测到1.09x10拷贝/“L的标准品阳性质粒;批内和批间变异系数均小于3%;23份临床样品检测的阳性率为48%。该方法可以用于鸡ORT感染的早期诊断及ORT的快速鉴定和定量分析。关键词:鼻气管鸟杆菌;TaqMan荧光定量PCR;16SrRNA基因中图分类号:$852.61文献标识码:A文章编号:1008.0589(2014)02.0121.04DevelopmentofTaqManreal—timePCRassayfordetection
3、oftheOmithobactelIlumrhinotrachealeLIFu-xiang,DUANZhi-hua,ZHAOWen—hua,XINAi-guo,YANGShi—biao,LIHua—chun’(1.YunnanAnimalScienceandVeterinaryInstitute,Kunming650224,China;2.BaoshanCenterforDiseaseControlandPrevention,Baoshan678000,China)Abstract:Toestablisharapidandhighthrough-putmethodforOmithobact
4、eriumrhinotrachealedetection,aTaqManreal-timePCRassaywasdevelopedforthebacteriadetectionwithapairofprimersandoneTaqManprobedesignedaccordingtothesequenceofthel6SrRNAgeneofO.rhinotracheale,whichwasamplifiedbyPCRandclonedintopMD19-TtoconstructstandardrecombinantplasmidofpMD-16S.Undertheoptimizedreac
5、tionconditions,thetestresultsshowedthatthismethodwasspecificfordetectingO.rhinotrachealewithadetectionlimitof1.09xl0。copies/IxL,andhadnocross—amplificationsforotherchickenbacteria,includingE.coli,Salmonella,Streptococcus,Staphylococcus,R.anaapestifer,Enterococcus,H.paragallinarum,P.mirabilisandG.a
6、natis.Therepeatabilitytestsindicatedthattheinter-andintra-variationwerelessthan3%.Therefore.thedetectionmethodcouldbeappliedinearlydiagnosisofO.rhinotrachealeinfections,rapididentificationandquantitativeassayofthebacteria.Keywords:Omithobacteriumrhinotracheale;TaqManreal-timePCR;16SrRNAgene鼻气管鸟杆菌(
7、Omithobacteriumrhinotracheale,增高,产蛋鸡的产蛋量减少。各种家禽和野禽对ORT)感染是禽类的一种接触性传染疾病,其临床症ORT均易感,该病呈世界分布[1_2]。近年来,我国的状主要表现为流鼻液、呼吸紊乱、死亡率和淘汰率多地报道了ORT感染,本研究室也于2011年在*Correspondingauthor收稿日期:2013.05.02基金项目:云南省农业科技创新工程(2008LA019);云南
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