goldenhar综合征家系收集、表型分析和遗传学的研究

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1、本人声明,工作及取得的研的地方外,论文包含为获得中南共同工作的同志作者签日期:心』^月坐日学位论文版权使用授权书本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留学位论文并根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文,允许学位论文被查阅和借阅;学校可以公布学位论文的全部或部分内容,可以采用复印、缩印或其它手段保存学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》,并通过网络向社会公众提供信息服务。作者签师签:坦年且尘、博士学位论文中文摘要摘要第一章Goldenhar综合征的家系收集及临床表型分析目的:分析Goldenhar综合征的表型

2、为该病的临床诊断提供依据;收集Golderthar患者的遗传资料,为揭示此类疾病的遗传基础及发生机制奠定基础。方法:分析69例Goldenhar综合征患者的临床资料及表型间的相关性。采集一Goldenhar综合征家系的全部成员及4组核心家系成员的的新鲜血液,试剂盒提取全基因组DNA。结果:69例患者中,绝大多数为散发(91.3%),男女患病机会均等;双侧受累39例(56.5%),单侧受累30例(43.5%,左14-右16);耳前赘(88.4%)、眼球皮样瘤(84.1%)和其它眼异常(52.2%)是主要症状,半侧颜面短小与口面裂、颌发育不良、除耳廓畸形及耳前赘外的其它耳异常呈正

3、相关(p

4、瘤;复杂表型;相关博士学位论文中文摘要第二章8例Goldenhar综合征患者的SALLI和TCOFI基因突变检测目的:为探索Goldenhar综合征的致病原因,筛查8例患者的.蜘比J7和TCOFl基因突变情况。方法:取8例患者及其父母和正常同胞的基因组DNA,PCR扩增姚J『和TCOFl的全部外显子及部分内含子,用直接双向测序、Blast比对进行突变分析。结果:在.鼢儿J『基因中发现2个多态数据库已报道的单核苷酸多态;在TCOFl基因中发现了7个序列变异,其中6个已被报道为多态,1个为新发现的内含子突变。所有序列变异都存在于患者的正常亲属中,与疾病表型无共分离现象。博士学位论

5、文中文摘要第三章Goldenhar综合征一家系及4组父母一患者核心家系的拷贝数变异分析目的:分析Goldenhar综合征患者的基因组拷贝数变异,寻找与该疾病相关的位点。方法:采用HumanCNV370一Quadv3.0芯片对家系成员及4组父母.患者核心家系进行拷贝数变异(CopyNumberVariation,CNV)的基因分型研究,芯片扫描结果用BeadStudio软件进行CNV分析,并对一个可能与患者表型相关的新发拷贝数变异进行real.timePCR验证。结果:CNV分析在三个散发患者中发现lO个新发的拷贝数变异,综合考虑DGV数据库、27个正常对照样本以及CNV区域的

6、基因信息情况,推测其中分别位于5q13.2、lq31.1和8p23.1区域的CNV可能与对应患者的表型相关,并用real.timePCR证实了5q13.2区域内的CNV在患者GSl中的存在。家系内CNV分析发现153个CNVs,但患者和正常个体间在CNVs数量和大小方面都没有明显差异,未发现与患者表型相关的QW。结论:通过CNV分析,发现位于5q13.2的单拷贝缺失、lq31.1的重复和8p23.1的单拷贝缺失可能分别与对应患者的表型相关。在一Goldenhar综合征家系的全基因组扫描数据中,没有发现与患者表型共分离的拷贝数突变,可能即使在同一家族内,其病因也是非常复杂的,要

7、阐明此类疾病的遗传基础将是一个非常具有挑战性的任务。关键词:全基因组扫描;SNP;微缺失;拷贝数变异III博士学位论文英文摘要ABSTRACTPARTIFamilycollectionandphenotypeanalysisofGoldenharSyndromeObjectiveToanalyzetheclinicalphenotypeandapplythereferenceddiagnoseforGoldenharsyndrome;TocollectthegeneticresourseofGolden

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