Goldenhar综合征家系收集、表型分析和遗传学研究

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1、博士学位论文中文摘要摘要第一章Goldenhar综合征的家系收集及临床表型分析目的：分析Goldenhar综合征的表型为该病的临床诊断提供依据；收集Golderthar患者的遗传资料，为揭示此类疾病的遗传基础及发生机制奠定基础。方法：分析69例Goldenhar综合征患者的临床资料及表型间的相关性。采集一Goldenhar综合征家系的全部成员及4组核心家系成员的的新鲜血液，试剂盒提取全基因组DNA。结果：69例患者中，绝大多数为散发(91．3％)，男女患病机会均等；双侧受累39例(56．5％)，单侧受累30例(43．5％，左14-右16)；耳前赘(88．4％)、眼球皮样瘤(84．

2、1％)和其它眼异常(52．2％)是主要症状，半侧颜面短小与口面裂、颌发育不良、除耳廓畸形及耳前赘外的其它耳异常呈正相关(p

3、内宝贵的遗传资源，为揭示此类疾病的遗传基础及发生机制奠定了良好的基础。关键词：半侧颜面短小；耳前赘；眼球皮样瘤；复杂表型；相关性博士学位论文中文摘要第二章8例Goldenhar综合征患者的SALLI和TCOFI基因突变检测目的：为探索Goldenhar综合征的致病原因，筛查8例患者的．蜘比J7和TCOFl基因突变情况。方法：取8例患者及其父母和正常同胞的基因组DNA，PCR扩增姚J『和TCOFl的全部外显子及部分内含子，用直接双向测序、Blast比对进行突变分析。结果：在．鼢儿J『基因中发现2个多态数据库已报道的单核苷酸多态；在TCOFl基因中发现了7个序列变异，其中6个已被报道

4、为多态，1个为新发现的内含子突变。所有序列变异都存在于患者的正常亲属中，与疾病表型无共分离现象。博士学位论文中文摘要第三章Goldenhar综合征一家系及4组父母一患者核心家系的拷贝数变异分析目的：分析Goldenhar综合征患者的基因组拷贝数变异，寻找与该疾病相关的位点。方法：采用HumanCNV370一Quadv3．0芯片对家系成员及4组父母．患者核心家系进行拷贝数变异(CopyNumberVariation，CNV)的基因分型研究，芯片扫描结果用BeadStudio软件进行CNV分析，并对一个可能与患者表型相关的新发拷贝数变异进行real．timePCR验证。结果：CNV分

5、析在三个散发患者中发现lO个新发的拷贝数变异，综合考虑DGV数据库、27个正常对照样本以及CNV区域的基因信息情况，推测其中分别位于5q13．2、lq31．1和8p23．1区域的CNV可能与对应患者的表型相关，并用real．timePCR证实了5q13．2区域内的CNV在患者GSl中的存在。家系内CNV分析发现153个CNVs，但患者和正常个体间在CNVs数量和大小方面都没有明显差异，未发现与患者表型相关的QW。结论：通过CNV分析，发现位于5q13．2的单拷贝缺失、lq31．1的重复和8p23．1的单拷贝缺失可能分别与对应患者的表型相关。在一Goldenhar综合征家系的全基因

6、组扫描数据中，没有发现与患者表型共分离的拷贝数突变，可能即使在同一家族内，其病因也是非常复杂的，要阐明此类疾病的遗传基础将是一个非常具有挑战性的任务。关键词：全基因组扫描；SNP；微缺失；拷贝数变异III博士学位论文英文摘要ABSTRACTPARTIFamilycollectionandphenotypeanalysisofGoldenharSyndromeObjectiveToanalyzetheclinicalphenotypeandapplythereferenceddiagnoseforGoldenharsyndrome；Tocollectthegeneticresour

7、seofGoldenharsyndromeforprovidingUSwiththeinformationtoexploreetiologicalfactorsforthisdisorder．MethodsAseriesof69patientswithGoldenharsyndromewereretrospectivelyreviewed，andPearson’scorrelationanalysiswereperformed．andtheirunaffectedparentsw