6种水蛭的coⅰ、12s rrna和16s rrna基因及分子进化分析

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1、第3O卷第6期生物学杂志V01.30No.62013年12月J0URNALOFBIOLOGYDec,2013doi:10.3969/j.issn.2095—1736.2013.06.0106种水蛭的COI、12SrRNA和16SrRNA基因及分子进化分析徐云玲,聂晶,肖凌(1.湖北省食品药品监督检验研究院,武汉430064;2.湖北中医药大学,武汉430065)摘要:水蛭是一种常见的传统中药,为了解常见蛭类细胞色素氧化酶亚基I(COI)、12SrRNA和16SrRNA基因特征和水蛭分子系统进化关系。对常用的入药品种El本

2、医蛭(Hirtdonipponia)、宽体金线蛭(Whitmaniapigra)、尖细金线蛭(Whitmaniaacranulate)和相近物种菲牛蛭(Poecilobdellamanillensis)、光润金线蛭(Whitmanialaevis)及八目石蛭(Erpobdellaoctoculata)的COI、12SrRNA和16SrRNA基因进行扩增、测序,利用Mega5.0分析基因特征、颠换率、分化年代,利用PAUP4.10b和MrBayes3.1.2构建分子系统树。结果表明6种水蛭的COI、12SrRNA和16Sr

3、RNA基因全长分别为1534~1536bp、709—744bp、1129~1173bp,GC含量分别为32.35%一34.79%、24.42%~28.49%、24.82%~27.02%,总体颠换率为0.002%一0.760%,分化年代为3.55×10a~9.85×10。a;每种水蛭为单系群的支持值均t>82。说明COI、12SrRNA和16SrRNA基因具有种间特异性,可用于6种水蛭的分类鉴别。关键词:水蛭;COI;12SrRNA;16SrRNA;分子进化中图分类号:Q78文献标识码:A文章编号:2095—1736(20

4、13)06—0010—04MolecularevolutionanalysisofCOI,12SrRNAand16SrRNAgeneinsixspeciesofleechxuYun.1ing一,NIEJing,XIAOLing,(1.HubeiInstituteforFoodandDrugControl,Wuhan430064;2.HubeiUniversityofChineseMedicine,Wuhan430065,China)Abstract:Toinvestigatetherelationshipbetweenc

5、ytoehromeoxidasesubunitI(COI),12SrRNAand16SrRNAgenetraitsandmolecularevolutionofleech,genesofcytoehromeoxidasesubunitI(COI),12SrRNAand16SrRNAfrom///rudonipponia,Poeci—lobdellamanillensis,Whitmaniapigra,Whitmaniaacranulate,WhitmanialaevisandErpobdeUaoctoculatawere

6、amplifiedandse—quenced.Genetraits.transversionratesanddivergencetimeswereanalyzed.MolecularphylogenetictreesweregeneratedusingPAUP4.1ObandMrBayes3.1.2.ThecompleteCO,12SrRNAand16SrRNAgeneswere1534bpto1536bp,709bpto744bpand1129bpto1173bp,GCcontentswere32.35%to34.79

7、%,24.42%to28.49%and24.82%to27.02%.respectively.Transver—sionrateswere0.002%to0.760%.Divergencetimeswerefrom3.55×10ato9.85×10a.Eachspeciesofleechshowedhighsup—portforamonophyleticgroup(BPP≥82).ConstructedCOI,12SrRNAand16SrRNAgeneshadspeciesspecificityandcanbeusedf

8、ortheidentificationofthesixspeciesofleech.Keywords:leech;COIgene;12SrRNAgene;16SrRNAgene;molecularevolution水蛭种质资源的分类是水蛭药材物质活性成分研局限性。线粒体DNA(mtDNA)细胞色素氧化酶亚究的基础,传

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