梭鱼和鲻鱼线粒体16S rRNA和COⅠ基因片段的比较分析.pdf

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1、第31卷第2期浙江海洋学院学报(自然科学片反)VoL31No．22012年3月JournalofZhejiangOceanUniversity(NaturalScience)Mar．，2012文章编号：1008—830X(2012)02—0103-04梭鱼和鲻鱼线粒体16SrRNA和COI基因片段的比较分析程国宝，李三磊，徐冬冬，薛宝贵，耿智，楼宝(浙江海洋学院海洋与渔业研究所，浙江省海洋水产研究所，浙江舟山316100)摘要：运用PCR技术，扩增了梭鱼和鲻鱼线粒体16SrRNA和COI基因片段，并比较分析了

2、其种间的序列差异。获得16SRNA基因的540～560bp碱基序列，出现26个碱基的插入与缺失位点；获得c0I基因的602～604bp碱基序列，出现2个插入缺失位点；16SrRNA和COI基因的序列中G平均含量最低，且(A+T)含量高于(G+C)含量，与其他鱼类中的16SRNA和COI基因片段研究结果相一致。在16SrRNA基因片段中，梭鱼出现1种单倍型，鲻鱼为2种单倍型；在COI基因片段中，梭鱼样品中检测到3个单倍型，鲻鱼样品中检测到5个单倍型。以Takifugupoecilonotus为外群，构建的NJ系

3、统发育树，基于16SrRNA和COI基因序列获得的NJ系统树基本一致，鲻鱼和梭鱼种内个体分别聚为一支，显示16SrRNA和COI基因适合于梭鱼和鲻鱼的物种鉴定。关键词：梭鱼；鲻鱼；16SrRNA；COI中图分类号：Q503文献标识码：ASequenceAnalysisof16SrRNAandCOIGeneFragmentofLizahaematocheilaandMugilcephalusCHENGGuo-bao，LISan-lei，XUDong-dong，etal(MarineandFishereryRes

4、earchInstituteofZhejiangOceanUniversity，MarineFisherierResearchInstituteofZhejiangProvince，Zhoushan316100，China)Abstract：The16SrRNAandcytochromeoxidasesubunitI(COI)genefragmentsofLizahaematocheilaandMugilcephaluswereamplifiedbyPCR，andthesequencevariationamo

5、nginterspecieswereanalyzed：Atotalof26insertionordeletionofsitesweredetectedfor16SrRNA；and2insertionordeletionofsitesweredetectedfor(COI)gene．TheaveragecontentofGwasthelowest，andthecontentof(A+T)washigherthanthatof(G+C)，whichwassimilartotheresultsreportedino

6、therfishspecies．For16SrRNA，onehaplotypewasobservedinL．haematocheilaand2haplotypeswereobservedinM．cephalus．AsforCOIgenefragments．3haplotypesweredetectedinL．haematocheilaand5haplotypesweredetectedincephalus．Takifugupoe一收稿日期：2011-12—28基金项目：浙江省科技计划项目f2010F20006

7、1作者简介：程国宝(1954一)，男，浙江台州人，工程师，研究方向：海水养殖浙江海洋学院学报(自然科学版)第31卷cilonotuswasemployedasoutgroup，andtheNeighbourJoining(NJ)phylogenetictreewasconstructed．There—suhsofNJtreebasedon16SrRNAandCO1wereaccordant．IntraspecificindividualsL．haematocheilaandM．cephaluswereinac

8、laderespectively．Thepresentresultindicatedthat16SrRNAandCO1wereapplica—bletomolecularidentification．Keywords：Lizahaematocheila；Mugilcephalus；16SrRNA；COI线粒体DNA由于具有分子结构简单，严格母系遗传、几乎不发生重组、进化速率快等优点，在动物种群的遗传