4种河蓝蛤线粒体coi和16s rrna基因序列的种间遗传分析

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1、第35卷第l期渔业科学进展Vo1．35，NO．12014年2月PR()GRESSINFISHERYSCIENCESFeb．，20144种河蓝蛤线粒体COI和16SrRNA基因序列的种间遗传分析孙超刘志鸿。杨爱国周丽青。吴彪。严加坤侯、r董春光(上海海洋大学水产与生命学院，201306)(。农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所，青岛266071)摘要对光滑河蓝蛤Potamocorbulalaevis、黑龙江河蓝蛤P．amurensis、焦河蓝蛤P．ustula—ta、红肉河蓝蛤P．rubromuscula4个野生种共40个个体的线粒体COl和16SrRN

2、A基因片段进行了扩增和测序，经过筛选和剪切，得到长度为650bp和450bp的片段。序列分析显示，序列的碱基组成中G+C含量较低，l6SrRNA基因种间和种内的变异较低，COI基因片段种内和种间的变异较高。以沙海螂Myaarenaria为外群，用MEGA4．0软件中的NJ法构建了系统进化树，通过遗传距离和系统进化树可以看出，4种河蓝蛤未能达到不同种之间显著的遗传分化。关键词河蓝蛤；线粒体；16SrRNA；COI；系统进化中图分类号S917．4文献标志码A文章编号10007075(2Ol4)01-0082—09GeneticanalysisofmitochondrialCO1and1

3、6SrRNAgenefragmentsinfourPotamocorbulaspeciesSUNChao～I．IUZhi～hongYANGAi—guo。ZHOULi—qing。WUBiaoYANJia—kun，HOUYaDONGChun—guang，。(CollegeofFisheriesandI．ifeScience。ShanghaiOceanUniversity，201306)(KeyLaboratoryofSustainableDevelopmentofMarineFisheries，MinistryofAgriculture，YellowSeaFisheriesResear

4、chInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Qingdao266071)ABSTRACTI、hegenefragmentsOfthemitochondrialCOIand16SrRNAinPotamocorbulalaevis，P．amurensis，P．ustulataandP．rubromusculawereamplifiedandsequenced．Total—ly，40sequencesofCOIgeneand16SrRNAwereobtained，andaftertrimmingtheywere650bpand450bpresp

5、ectivelyinlengthwithlowGCcontent．Theresultsofsequenceanalysisshowedthattheintraspecificvariationandinterspecificvariationwerelowerin16SrRNAthanthoseinC()1gene．Tenmutationsitesandsevenhaplotypesweredetectedinthegenefragmentsofl6SrRNA．TakingMyaarenariaastheout—group，thephylogenetictreesofC()Iand

6、16SrRNA科技部基础]_作专项“我国再要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建”(2013FY110700)和国家科技基础条件平台项目“黄渤海区水生物种质资源标准化整理、整合与共享”共同资助*通讯作者。Email：liuzh@ysfri．aC．cn，Tel：(0532)85836340收稿}{期：20130306；接受日期：20130401作者简介：孙超(1987)，男，硕士研究生，主要从事贝类遗传育种研究。E—mail：yuheng2008@163．COI1第1期孙超等：4种河蓝蛤线粒体CO1和16SrRNA基因序列的种间遗传分析83wereconstructedbyth

7、eneighbor—joining(NJ)methodusingsoftwareMEGA4．0．BasedonthegeneticdistanceinNJphylogenetictree，wefoundthatthefourspeciesofPotamocorbulafailedtoachievesignificantgeneticdifferentiationbetweenspecies．KEYWORDSPotamocorbula；mtDNA；16SrRNAgene