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《梭鱼和鲻鱼线粒体16S rRNA和COⅠ基因片段的比较分析.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第31卷第2期浙江海洋学院学报(自然科学片反)VoL31No.22012年3月JournalofZhejiangOceanUniversity(NaturalScience)Mar.,2012文章编号:1008—830X(2012)02—0103-04梭鱼和鲻鱼线粒体16SrRNA和COI基因片段的比较分析程国宝,李三磊,徐冬冬,薛宝贵,耿智,楼宝(浙江海洋学院海洋与渔业研究所,浙江省海洋水产研究所,浙江舟山316100)摘要:运用PCR技术,扩增了梭鱼和鲻鱼线粒体16SrRNA和COI基因片段,并比较分析了
2、其种间的序列差异。获得16SRNA基因的540~560bp碱基序列,出现26个碱基的插入与缺失位点;获得c0I基因的602~604bp碱基序列,出现2个插入缺失位点;16SrRNA和COI基因的序列中G平均含量最低,且(A+T)含量高于(G+C)含量,与其他鱼类中的16SRNA和COI基因片段研究结果相一致。在16SrRNA基因片段中,梭鱼出现1种单倍型,鲻鱼为2种单倍型;在COI基因片段中,梭鱼样品中检测到3个单倍型,鲻鱼样品中检测到5个单倍型。以Takifugupoecilonotus为外群,构建的NJ系
3、统发育树,基于16SrRNA和COI基因序列获得的NJ系统树基本一致,鲻鱼和梭鱼种内个体分别聚为一支,显示16SrRNA和COI基因适合于梭鱼和鲻鱼的物种鉴定。关键词:梭鱼;鲻鱼;16SrRNA;COI中图分类号:Q503文献标识码:ASequenceAnalysisof16SrRNAandCOIGeneFragmentofLizahaematocheilaandMugilcephalusCHENGGuo-bao,LISan-lei,XUDong-dong,etal(MarineandFishereryRes
4、earchInstituteofZhejiangOceanUniversity,MarineFisherierResearchInstituteofZhejiangProvince,Zhoushan316100,China)Abstract:The16SrRNAandcytochromeoxidasesubunitI(COI)genefragmentsofLizahaematocheilaandMugilcephaluswereamplifiedbyPCR,andthesequencevariationamo
5、nginterspecieswereanalyzed:Atotalof26insertionordeletionofsitesweredetectedfor16SrRNA;and2insertionordeletionofsitesweredetectedfor(COI)gene.TheaveragecontentofGwasthelowest,andthecontentof(A+T)washigherthanthatof(G+C),whichwassimilartotheresultsreportedino
6、therfishspecies.For16SrRNA,onehaplotypewasobservedinL.haematocheilaand2haplotypeswereobservedinM.cephalus.AsforCOIgenefragments.3haplotypesweredetectedinL.haematocheilaand5haplotypesweredetectedincephalus.Takifugupoe一收稿日期:2011-12—28基金项目:浙江省科技计划项目f2010F20006
7、1作者简介:程国宝(1954一),男,浙江台州人,工程师,研究方向:海水养殖浙江海洋学院学报(自然科学版)第31卷cilonotuswasemployedasoutgroup,andtheNeighbourJoining(NJ)phylogenetictreewasconstructed.There—suhsofNJtreebasedon16SrRNAandCO1wereaccordant.IntraspecificindividualsL.haematocheilaandM.cephaluswereinac
8、laderespectively.Thepresentresultindicatedthat16SrRNAandCO1wereapplica—bletomolecularidentification.Keywords:Lizahaematocheila;Mugilcephalus;16SrRNA;COI线粒体DNA由于具有分子结构简单,严格母系遗传、几乎不发生重组、进化速率快等优点,在动物种群的遗传
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