用16S rRNA基因对九种蟹系统学分析【毕业设计】

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1、本科毕业设计（20__届）用16SrRNA基因对九种蟹系统学分析目录1引言11.1蟹类的生物学特征11.2研究历史与现状11.3研究意义21.4主要研究内容21.5应解决的问题32.实验材料与方法32.1样品32.2试剂32.3设备32.4实验方法33.结果与分析43.1核苷酸组成分析43.2遗传距离分析73.3系统进化树84.结果与讨论84.1线粒体基因与动物系统发育重建84.2本研究中9种蟹的系统发育分析95.小结10致谢11参考文献12摘要：蟹类是水产养殖中的重要经济物种，分布广泛于咸淡水中，具有一定的经济价值。但由于从形态学和细胞学

2、上对其分类有一定的难度，所以利用分子生物学手段鉴定其种类，研究其系统发育情况已经成为主流。本文利用蟹类的线粒体16SrRNA基因片段序列分析的方法，对9种蟹类进行了分子系统学研究。经多重比对和软件分析，得到了种间序列的遗传距离并构建了最大简约（MP）系统树。结果表明：秉氏厚蟹和日本蟳两种蟹类具有较近的亲缘关系，这与他们在传统形态学分类上的分类地位有出入。而其余蟹类的进化关系与传统分类学结果是相一致的。该研究可以为蟹类的分类问题及亲缘关系提供一定的分子生物学依据。关键词：蟹类；系统发育；线粒体16SrRNA基因；亲缘关系Abstract:Cr

3、abisanimportanteconomicaquaculturespecies,whichwidelydistributedinsaltyandfreshwaterandhassomeeconomicvalue.However,duetothetheirclassificationbasedonmorphologyandcytologyhasacertaindifficulty,sousethemeansofmolecularbiologytoidentifythetypesandstudythephylogenysituationof

4、themhavebecomingmainstream.Inthispaper,weusethemitochondrial16SrRNAgenesequenceanalysisandcarryoutthe9kindsofcrabsmolecularsystematics.Aftermultiplecomparisonandsoftwareanalysis,wegetthesequenceofthegeneticdistancebetweenspeciesandbuildamaximumparsimony(MP)phylogenetictree

5、.Theresultshowsthat:threecrabsofHelicepingiandCharybdisjaponicahaveacloserrelationship,whichhasthediscrepancyoftheirclassificationpositionfortraditionalmorphlogicalclassification.Theevolutionaryrelationshipsoftheremainingcrabsandthetraditionaltaxonomyisconsistentwiththeres

6、ults.Thestudycanprovideamolecularbiologybasisoftheclassificationproblemsforcrabsandrelationships.Keywords:Crabs;Phylogenetic;Mitochondrial16SrRNAgene;Relationships1引言1.1蟹类的生物学特征1.1.1简介蟹是十足目（Decapoda）短尾次目的甲壳动物，尤指短尾族（Brachyura）的种类（真蟹），也包括其他一些类型，如歪尾族（Anomura）的种类。常见的有关公蟹、梭子蟹、溪

7、蟹、招潮蟹、绒螯蟹等属，总共约4500种，见于所有海洋、淡水及陆地。通常以步行或爬行的方式移动。蟹类通常为杂食性，多食腐，有些能与其他动物共生。1.1.2分布范围大部分蟹类生活于海中，甚至热带国家数量丰富的陆蟹，也不时到海里活动，其生命的早期也在海中度过。世界大部分温暖地区都有丰富的淡水蟹资源，例如南欧长于河水中的春蟹（Potamonfluviatile）。蛙蟹科、馒头蟹科、玉蟹科、梭子蟹科、扇蟹科主要生活在沿岸带；方蟹科、沙蟹科生活在广阔的潮间带。极少数如漂泊蟹和弓腿蟹能附着在木材或其他漂浮物上生活。也有不少种类与其他动物营共栖生活，如绵

8、蟹科，关公蟹科。许多种如豆蟹常潜入一些软体动物的外套腔中、或多毛类的管道中共栖。一小部分蟹类完全在淡水中生长繁殖，它们多栖息于山区溪流的石块下。还有少数蟹类如地蟹能适应陆地生活，