用C0I和16S基因对蟹类系统学分析的综述研究【文献综述】

用C0I和16S基因对蟹类系统学分析的综述研究【文献综述】

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1、毕业论文文献综述海洋生物资源与环境用C0I和16S基因对蟹类系统学分析的综述研究摘要:蟹类是水产养殖中的重要经济物种,分布广泛,咸淡水中都有很高的物种丰度,具有一定的经济价值。但由于从形态学和细胞学上对其分类有一定的难度,所以利用分子生物学手段鉴定其种类,研究其系统发育情况已经成为主流。本文将重点探讨国内外研究人员利用C0I和16S基因对生物(尤其是蟹类)进行系统学分析的发展情况。关键词:蟹类;生物学特性;C0I和16S基因;系统学分析很久以来,关于海洋动物的分类及系统进化关系研究仍局限于对其形态学和细胞学方法。由于形态学和细胞学特征往往是基因表达的结果,可比较的分类信息较少且易受到环境等多种

2、因素影响,所以关于包括蟹在内的许多水生动物的分类及系统进化关系一直是困扰人们的难题。自20世纪60年代以来,蛋白质和DNA等信息大分子被广泛应用于生物系统学研究,克服了在利用形态学和细胞学方法对海洋动物做分类和系统进化研究时的诸多缺点,消除了很多海洋动物分类和系统进化研究中的争议,极大地促进了海洋动物分子系统学的发展。蟹类作为重要的水产养殖物种,一直以来也是广大科研工作者重点研究的对象。本文将从多角度解析利用分子生物学手段(主要是利用C0I和16S基因)对生物进行系统发育学的研究进展,并简要阐述该研究的发展动向和趋势,以及存在的一些问题。1.蟹类生物学特性1.1简介蟹是十足目(Decapoda

3、)短尾次目的甲壳动物,尤指短尾族(Brachyura)的种类(真蟹),也包括其他一些类型,如歪尾族(Anomura)的种类。常见的有关公蟹、梭子蟹、溪蟹、招潮蟹、绒螯蟹等属,总共约4500种,见于所有海洋、淡水及陆地。通常以步行或爬行的方式移动。蟹类通常为杂食性,多食腐,有些能与其他动物共生。1.2分布范围大部分蟹类生活于海中,甚至热带国家数量丰富的陆蟹,也不时到海里活动,其生命的早期也在海中度过。世界大部分温暖地区都有丰富的淡水蟹资源,例如南欧长于河水中的春蟹(Potamonfluviatile)。蛙蟹科、馒头蟹科、玉蟹科、梭子蟹科、扇蟹科主要生活在沿岸带;方蟹科、沙蟹科生活在广阔的潮间带。

4、极少数如漂泊蟹和弓腿蟹能附着在木材或其他漂浮物上生活。也有不少种类与其他动物营共栖生活,如绵蟹科,关公蟹科。许多种如豆蟹常潜入一些软体动物的外套腔中、或多毛类的管道中共栖。一小部分蟹类完全在淡水中生长繁殖,它们多栖息于山区溪流的石块下。还有少数蟹类如地蟹能适应陆地生活,穴居于潮湿的泥洞中,繁殖时期则迁移下海。1.3形态特征蟹的身体分为头胸部与腹部。头胸部的背面覆以头胸甲,形状因种不同而不一样。额部中央具第1、2对触角,外侧是有柄的复眼。口器包括1对大颚,2对小颚和3对颚足。头胸甲两侧有5对胸足。腹部退化,扁平,曲折在头胸部的腹面。雄性腹部窄长,多呈三角形,只有前两对赴肢变形为交接器;雌性腹部宽

5、阔,第2-5节各具1对双枝型附肢,密布刚毛,用以抱卵。1.4经济价值蟹类中可供使用的主要有三疣梭子蟹、远海梭子蟹、青蟹和中华绒螯蟹等,具有较高的营养价值。蟹壳可用以提炼工业原料甲壳素,也可提制葡糖胺。有些蟹类可作中药用。蟹幼体或成体可作饲饵或饲料。所以蟹类具有很好的经济价值和市场开发力。2.C0I和16S基因在生物分子系统学研究中的应用DNA分子作为遗传信息的直接载体,不受环境、生物发育阶段及器官组织的影响,因而能较为准确地反映出各个物种间的系统发生关系。而在这其中,线粒体DNA(mtDNA)的优势又更加明显。其具有母系遗传、变异大、无组织特异性等优点,且检测方便,因而在动物的分类、遗传变异分

6、析和系统进化等领域应用广泛。其中尤以编码线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(CytochromecOxidasesubunitI,简称COI)和16SrRNA基因在动物分子系统学的研究中应用最为广泛。2.1在动物系统发育重建中的应用利用C0I和16S基因片段键的DNA序列差异性构建的分子系统树已经解决了很多动物之间的系统发生关系。鹟亚科(Muscicapinae)隶属于雀形目鹟科,在全世界分布有328种。目前国内外对鹟亚科的分类系统很不统一。2007年报道,雷忻等人采用PCR扩增、测序的方法,对鹟亚科6属16种鸟类的线粒体COI基因序列1176bp进行测定,并以荒漠伯劳和发冠卷尾作为外群构建Baye

7、s、ML、MP3棵系统发育树。结果支持:寿带属、扇尾鹟属、方尾鹟属3属于鹟亚科其他鸟类亲缘关系较远,扇尾鹟属于方尾鹟属亲缘关系较近,鹟属为单系发生。该结论解决了鹟亚科部分属间的进化关系,为鹟亚科分类系统的研究提供了分子水平证据。蛏类在食用贝类中占有相当重要的地位,基于形态性状学对蛏类的分类存在某些不同观点,齐钟彦将3钟蛏归为竹蛏科(Solenidae),分属竹蛏属(Solen)和刀蛏属(Culte

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