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时间:2017-08-08
《两株弧菌的分子鉴定【毕业设计】》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、本科毕业设计(20__届)两株弧菌的分子鉴定目录摘要(Abstract)1引言……………………………………………………………………………………………………………..11.1弧菌分类学现状与分类学历史………………………………………………………………………..11.1.1弧菌分类学现状……………………………………………………………………..……………..11.1.2弧菌分类学历史…………………………………………………………………………………...11.216SrRNA简介与应用……………………………………………………………………………………11.3研究的意义与内容…………………………………………
2、……………………………………………22材料与方法……………………………………………………………………………………………………..22.1实验材料、仪器和试剂…………………………………………………………………....……………..22.1.1材料…………………………………………………………………………………………………..22.1.2仪器与设备…………………………………………………………………………………………22.1.3试剂………………………………………………………………………………………………...32.2方法与步骤……………………………………………………………………………………………….
3、.32.2.1实验材料准备及形态学观察………………………………………………………..........................32.2.2改良弧菌DNA提取方法……………………………………………………………………………...32.2.3DNA测定………………………………………………………………………………………………42.2.4PCR扩增与测序…………………………………………………………………………………….42.2.5生物信息学分析……………………………………………………………………………………...53结果与分析……………………………………………………………………………………...
4、.......................53.1两株弧菌的分离及形态学观察…………………………………………………………………………...53.2两株弧菌的DNA提取及其测定……………………………………………………..…………………..63.316SrRNA基因的PCR扩增与测序…………………………………………………………………………73.416SrRNA基因序列分析………………………………………………………………...............................83.5系统发育分析…………………………………………………………………………...................
5、............84.讨论…………………………………………………………………………………………….……………….94.1形态学观察…………………………………………………………………………………………………94.2改良弧菌DNA提取方法………………………………………………………………………………..104.3弧菌分子鉴定结果……………………………………………………………………….........................105结论…………………………………………………………………………………………….……………...10参考文献……………………………………………………………………
6、……………………………………12附录………………………………………………………………………………………………………………13附录一:XHS2-9号菌株的16SrRNA基因测序结果………………………………………………………13附录二:461号菌株的16SrRNA基因测序结果…………………………………………………………….13摘要:本文选用的环境样品为朱家尖浅水区水样,利用TCBS培养基培养梯度稀释平板法分离纯化出相应的两株未知优势弧菌。本文建立了一种基于CTAB-NaCl法的改良弧菌DNA提取的方法,该法通过高盐和CTAB对黏性多糖的沉淀而除去多糖,从而从富含黏性多糖的弧菌中提取获得了高质量的
7、DNA。以16SrRNA基因作为分子标记对环境样品中分离的两株未知弧菌样品进行系统发育学分析从而对其分类学地位进行鉴定,鉴定结果为461号菌株为弧菌属(Vibrio)的溶藻弧菌(V.alginolyticus),而XHS2-9号菌株为弧菌属(Vibrio)的哈维氏弧菌(V.harveyi)。关键词:弧菌;16SrRNA;分子鉴定;系统发育学分析Abstract:Thisessayselectedforenvi
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