广东省2007-2013年肠炎沙门菌耐药特征和分子分型研究

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1、■、.—--二:分类号密级UDC编号讀^着抑爹硕壬学位论文广东巧2007-2013年巧炎沙n苗贈葫特征和分子分型研究Theanalysisonan行microbialresistanceandmoleculartypingof-Salmonellaent:entidisinGuangdong,20072013刘谢导师巧名俞守义教巧柯置文主任技巧专化名巧流行巧与卫生巧计学培养类型学术型

2、论文巧交日期20巧年05月■—-—-.---.-:南方医科大学2012级硕壬学位论文广东省2007-2013年肠炎沙口菌耐药特征及分子分型研究Theanalysisonan村microbialresistanceandmolecular-tinofSalmonellaen化ritidisinGuandon20072013ypggg,2GGH000018-01课题来源:中美新发和再发传染病合作项目(1U)广东地区鼠伤寒沙口菌耐药特

3、征数据库的建立及应用2013B060400012()学位申请人刘谢导师姓若俞守义教授柯昌文主任技师专业名称流行病与卫生统计学培养类型学术型培养层次硕去研究生所在学院公共卫生与热带医学学院答辩委员会主席任泽祇教授答辩委员会委员杨莖教授曾年华研究员傅传喜主任医师陈青山教授2015年05月29日广州硕去学位论文广东省2007-2013年肠炎沙口菌耐药特征及分子分型研究硕壬研究生:刘谢指导老师:俞守义教授柯昌文主

4、任技师摘要研充背景;沙口菌是革兰氏阴性杆菌,在,属肠杆菌科自然界有广泛宿主分布,存在于大多数动物及人的胃肠道中;也常常存在于水、蛋及蛋制品、肉类及其他食品中。根据0抗原(茵体抗原)及H抗原(鞭毛抗原)的抗原特性进行分类,沙口菌有2500多种血清型、肠炎沙口菌是人兽共患最常见;其中鼠伤寒沙口菌的血清型。患者感染常出现腹泻、腹痛、呕吐等症状;沙口菌感染多为自限性,患者可自愈疾病,但败血症等并发症需要抗生素治疗。,目前,临床上治疗沙口菌病时主要采用唾诺丽类和H代头抱菌素

5、类抗生一素,已,随着使用时间和使用频次的积累有相当部分耐药菌株产生。据美国国家抗生素耐药监测系统(nationalantimicrobialKsistancemonitoring巧stem,一最近的报道显示.。NARMS,225%的非伤寒沙口菌至少耐种抗生素肠炎沙)口菌出现了多重耐药(multidrugresistance,MDR)现象。s-民质粒介导(PlamidMediatedQuinoloneResistance,FMQ)是沙口菌耐药的重要机制。目

6、前有3类报道较多的PMQR质粒基因,分别是qnr(编码Qnr’'aac6-比-cr(编--cr蛋白、A(A蛋白。蛋白)、()码AAC(6)比)qep编码Qep)PMQR主要介导低水平的耐药,但也可累积突变,引起高水平的耐药。PMQRI中文摘要阳性菌主要W多耐药基因同时出现为主,呈多重耐药表型,且不同地区也有不同的分布。沙口菌污染食品致腹泻暴发由W前的点源性集中暴发,越来越多地转变为跨地区跨州(省)的散在暴发形式出现,使污染源及传播途径的发现更需要分子分

7、一般包括三种型手段的辅助及确认。分子水平上的分型方法:基于DNA序列多态性分析的分型方法、基于扩增特定基因产物的PCR分型方法、化及基于细菌DNA的限制性内切酶分析的分型方法。脉冲场凝胶电泳(pulsedfieldgelelectrophoresis,PFGE)是20世纪80年代中A分子的一种电泳技术期发展起来的用于分离大分子量线性DN,被誉为细菌分""子生物学分型技术的金标准。其原理是在琼脂糖凝胶上外加方向、时间与电流大小交替改变的脉冲电场,从而使得DNA分子得

8、到有效地分离。通过比较DNA分子电泳图谱来确认菌株之间的关联。菌株间由于酶切位点突变、插入序列不一般认为电泳条带差异越少则基因差异越小同等原因会产生不同图谱,菌株,亲缘关系则越近;反之则菌株间无相关性,但对亲缘关系较远的菌株分型效果一。不佳,。PFGE适于研究个暴发事件中菌株之间的来源关系-tMLST多位点序列分型技术(multilocussequenceyping,)基于核酸序列测定技术,通过测定基因序列的变化反映菌株之间的进化关系,在

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