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1、上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型探究摘要:[目的]研究上海市2006―2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002―2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006―2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P3.8,P<0.05),对三代喹诺酮和三代头孢菌素的耐药
2、性与腹泻株接近。体检株对大多数抗生素表现敏感,除氨苄西林、复方磺胺甲�唑、庆大霉素、磺胺甲基异�唑、链霉素的耐药率高于腹泻株,其他10种抗生素的耐药率均接近或低于腹泻株(图2)。注:四环素(TET)、头孢噻夫(EFT)、阿莫西林/克拉维酸(AMC)、氨苄西林(AMP)、复方磺胺甲�唑(SXT)、环丙沙星(CIP)、氯霉素(C)、氧氟沙星(OFX)、萘啶酸(NA)、头孢吡肟(FEP)、头孢噻肟(CTX)、甲氧苄氨嘧啶(W)、头孢他啶(CAZ)、庆大霉素(CN)、磺胺甲异�9唑(S3)、链霉素(S)、DT104:AMP-C-S-S3-TET图22005―2007年上海市鼠伤寒沙门菌耐药监测2.4鼠
3、伤寒沙门菌株的PFGE分型51株鼠伤寒沙门菌共分为23种带型。44株临床株分21个带型,优势带型为1型(8株)、49型(8株)、2型(6株)和29型(4株),其他多数PFGE型仅对应有1株。1型与2型图谱间差异较小,显示同源性达95%。7株鼠伤寒沙门菌食源株的PFGE分型结果未见与1型和2型可匹配或近源的菌株图谱,除2株独立的菌型外其余5株中有4株(包括2株来自猪舌、1株猪心、1株鸡心)食源株与4株49型腹泻株图谱完全匹配,余下的1株(来自秋刀鱼)与3株6型腹泻株的图谱完全匹配。根据菌株分离编号、地点和分子型之间的对应分布判断:2006年鼠伤寒沙门菌PFGE的优势克隆型为2型,区域分布显示长宁
4、区曾发生过1次3人次以上的较小规模爆发病例。2007年鼠伤寒沙门菌PFGE的优势克隆型为1型,区域分布显示黄浦区曾发生过1次4人次以上的小规模爆发病例。其他非优势型的鼠伤寒病例均为散在分布,没有显示集中爆发的病例特征与分子特征(表1)。9PFGE图谱的聚类结果表明,鼠伤寒沙门菌病例的1型和2型菌株之间未见与之匹配的食源菌株,而开展同步食源性监测获得的7株菌中有5株(49型和6型)分别与7例鼠伤寒散发病例同源,与1株48型食源菌株(来自文蛤)共计13株构成一个在遗传上有95%以上相似性的克隆族;而1型与2型鼠伤寒沙门因相互间的遗传同源性达到90%,共同构成了优势腹泻型,具有流行菌株的遗传学特征。
5、由此判断,源于本地超市、卖场等市场中流通的生鲜类食品中分离的鼠伤寒沙门菌株仅与部分散发病例存在关联,而具有规模爆发能力的鼠伤寒沙门菌流行菌株与本地区流通生鲜食品之间则缺少足够的生态与遗传学依据来证明两者的关联性(图3见119页)。3讨论9GSS是以腹泻病例监测为基础,重点针对非伤寒沙门菌引起的“散在爆发”案例,并开展沙门菌的高危血清型监测和食源性溯源调查研究的全球范围的合作项目。随着学科的发展需求和实验室技术越来越全球化、标准化,有助揭示监测结果中造成“多点”或“局部”沙门菌流行的个别优势血清型的分子流行病学特征[4,5]。鼠伤寒沙门菌曾是最早被发现能引发大规模食物中毒的非伤寒沙门菌,并列为近
6、年全球和我国食源性沙门菌爆发案例的主要病原之一。本次GSS监测数据中鼠伤寒沙门菌株月报表所绘制的流行曲线,反应2006―2007年本市鼠伤寒沙门菌临床腹泻病例检出数频率相对符合肠道传染病的一般规律;菌型序列统计显示,2006―2007年鼠伤寒沙门菌病例数均仅次于肠炎沙门菌之后排第2位。2008年中国GSS年会资料显示,2006―2008年度国内部分省市(四川、重庆等)、地区在食源性爆发病例中鼠伤寒沙门菌占有非常显著的位置。确认鼠伤寒沙门菌本地病例的流行株是否和本地供应的食品原材料之间存在必然或潜的联系也是本次个案研究的重要目的。基于GSS项目系统完整的菌株资源,并整合本市非伤寒沙门菌血清型监测
7、的历史数据,回顾性分析45株食源性鼠伤寒沙门菌结果表明:80%以上的鼠伤寒沙门菌源于禽、畜等肉制品,是否可以认为这是流行菌株的源头,或至少可以说明在加工和销售过程中频频被污染的肉制品是本市鼠伤寒沙门菌病例的高危“媒介”,这为食品卫生监督部门对大型超市、集市及餐饮场所做好生鲜食品安全风险评估,和在企事业单位食堂或家庭宴请时强调“生熟分开”提供了科学的管理依据。我们根据美国Pulse9Net监测中负责
