tmv、pvy福建分离物分子鉴定及末端区域变异分析

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1、万方数据烟草科技／TobaccoScience＆Technology病虫害防治／Disease&PestControl2011年第5期(总第286期)TMV、PVY福建分离物分子鉴定及末端区域变异分析杨军1。张俊祺1，罗朝鹏1，赖荣泉2，曾文龙2。李锋1，宋纪真1，尹启生11．中国烟草总公司郑州烟草研究院，郑州高新技术产业开发区枫杨街2号4500012．福建省烟草公司龙岩市公司，福建省龙岩市龙岩大道288号364000关键词：烟草普通花叶病毒(TMV)；马铃薯Y病毒(PVY)；RT—PCR；分子鉴定；变异摘要：为及时准确地鉴定出病毒病原和追踪了解病毒病流行变异趋势

2、，使用特异性引物对福建烟区病毒烟叶样品进行RT．PCR分析，分别鉴定出病毒病原为TMV和PVY。序列测定结果表明PCR扩增产物为预期的TMV5’末端和PVY3’末端序列，大小分别为959和646个核苷酸，均包含末端非编码区和部分病毒功能基因蛋白编码区。将所获得的病毒末端序列与国内外报道的主要病毒分离物的同一区域进行比较，分析结果显示TMV5’端非编码区保守性极强，不同分离物之间部分126kDa或183kDa编码蛋白N端编码区表现出一定程度的变异(突变)，PVY外壳蛋白编码区与3’末端非编码区变异数量差异不大，变异(突变)均主要为碱基转换，环境自然选择压力对病毒基因

3、组变异(突变)具有一定的影响。中图分类号：$432．41文献标识码：A文章编号：1002—086l(2011)05—0074—06MolecularIdentificationandVariationAnalysisofTerminalRegionforTMVandPVYIsolatesfromFujianYANGJUN(1)，ZHANGJUN-QI(1)，LUOCHAO-PENG(1)，LAIRONG-QUAN(2)，ZENGWEN—LONG(2)，LIFENG(1)，SONGJI—ZHEN(1)，andYINQI-SHENG(1)1．ZhengzhouToba

4、ccoResearchInstituteofCNTC，Zhengzhou450001，China2．LongyanCorporationofFujianProvinceTobaccoCorporation，Longyan364000，Fujian，ChinaKeywords：TobaccomoscLicvirus(TMV)；PotatovirusY(PVY)；RT—PCR；Molecularidentification；VarimionAbstract：Toaccuratelyandtimelyidentifyviralpathogensandtrackvaria

5、tionandepidemictrendofviraldiseases，specificprimerswereusedinRT—PCR，bywhichTMVandPVYwereidentifiedrespectivelyfrominfectedtobaccoleavescollectedfromFujianProvince．Theresultsofviralsequenceanalysisshowedthattheamplificationproductswerethe5’terminalregionofTMVandthe3’terminalregionofPVY

6、withsequencelengthsof959and646ntrespectively，bothincludingofterminalnoncodingregionandpartofthecodingregionofviralfunctionalgeneticprotein．ComparingtheobtainedterminalsequencewiththesameregionsoftheviralisolatesinNCBIrevealedthatthenoncodingregionof5’terminalendofTMVwashighlyconservat

7、ive，Nterminalcodingregionofsomeof126kDaor183kDaproteinamongdifferentTMVisolatespresentedsomevariations(mutations)．Intermsofnumericaldifferencesofvariation，thedifferencebetweenCPcodingregionand3’terminalregionofPVYwasnotapparent．Thevariations(mutations)mainlycamefrombaseconversion．Natu

8、ralse