初发鼻咽癌与复发鼻咽癌差异表达基因的研究

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1、初发鼻咽癌与复发鼻咽癌差异表达基因的研究作者：黄振校，李文峰，杜季梅，黄亚，谭映霞，方渭清，廖志苏【摘要】目的：通过全基因组基因芯片研究初发鼻咽癌(pNPC)与复发鼻咽癌（rNPC）之间的差异表达基因。方法：选择rNPC和pNPC组织标本，应用AffymetrixGene1.0ST芯片，构建表达谱，检测两者之间的差异表达基因。结果：rNPC组与pNPC组比对，发现差异基因46个，下调基因38个，上调基因8个。这些基因参与钙结合、蛋白结合、酶活性调节等过程。结论：rNPC和pNPC之间存在基因差异表达，为了解rNPC的发生机制的研究起了一定的作用。【关键词】复发；鼻

2、咽肿瘤；基因芯片；基因表达　　Abstract:Objective:Tostudythedifferentiallyexpressedgenesbetweenrelapsednasopharyn-gealcarcinoma(rNPC)andprimarynasopharyngealcarcinoma（pNPC）bythewholehumangenomegenechips.Methods:pNPCtissuesamplesandrNPCtissuesampleswereselected，andAffymetrixGene1.0STchipswereusedtocon

3、structtheexpressionprofilingofeachtissuesample.Thedifferentiallyexpressedgeneswereexaminedwith12bioinformatics.Results:Atotalof46geneswasidentifiedtobedifferentialexpressedinrNPC.Thirtyeightgenesweredown-regulation，8geneswereup-regulation.Thesegenesparticipatedintheprocessesofcalciumi

4、onbinding，proteinbinding，adjustmentofenzymeactivitygenesandsoon.Conclusion:ThedifferentiallyexpressedgenesexistbetweenpNPCandrNPC，itmayplayanimportantroleinthemechanismofoccurrenceanddevelopmentofrNPC.　　Keywords:relapsed；nasopharyngealneoplasma；genechips；geneexprssion　　鼻咽癌是头颈部常见的鳞状细胞癌

5、之一。它具有明显的区域分布特征：在亚洲人中常见，特别是中国南方和东南亚地区（患病率：15～50/100000）[1]。目前，鼻咽癌的发生机制尚未明确。它的发病可能与环境因素、饮食，特别是EB病毒感染等因素有关[1-2]。近些年研究发现，大量的细胞增生功能通路在鼻咽癌中上调，比如Akt通路、有丝分裂原激活通路、Wnt通路及生长因子受体通路等[3]。遗传学和流行病学调查显示，HLA抗原单倍体HLA-2，HLA-B17，HLA-Bw26综合作用可以使鼻咽癌的发生风险增加两倍[4]。3号染色体长臂21区域的基因异常表达可能导致家族型鼻咽癌的发生[5]。12　　临床资料显示

6、，经过放射治疗后，有10%～36%的鼻咽癌患者会出现鼻咽局部复发，其中65%～85%发生在治疗后的前3年内[6]。以往的研究主要针对鼻咽癌组织与正常或癌旁组织之间基因差异表达[7-8]，未见初发鼻咽癌与复发鼻咽癌之间基因差异的研究。本研究用基因芯片研究初发鼻咽与复发鼻咽癌之间的差异表达基因，可能为了解复发鼻咽癌的发生机制提供分子依据。　　1材料和方法　　1.1芯片　　全基因组寡核苷酸芯片AffymetrixGene1.0ST芯片(GeneChipGene1.0ST)，包含33298个人类已知基因，含有17000个基因探针。　　1.2仪器与试剂　　RNA抽提试剂Tr

7、izol（invitrogen公司，美国）。HybridizationControlKit，IVTLabelingKit，One-CyclecDNASynthesisKit，Streptavidin-Phycoerythrin，GenearrayScanner3000，AffymetrixFluidicsStation450，AffymetrixGenechipHybridization12Oven640，GCOS1.2均为美国affymetrix公司产品。　　1.3组织标本　　本研究组织标本取自温州医学院附属第一医院耳鼻喉科，初发鼻咽癌组织8份，复发鼻咽癌组织6

8、份，病理诊