草鱼LXRα基因的克隆及表达研究.pdf

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1、第42卷第6期西北农林科技大学学报(自然科学版)Vo1．42No．62014年6月JournalofNorthwestA&FUniversity(Nat．Sci．Ed．)Jun．2014网络出版时间：2014—05—2811：34DOI：10．13207／j．cnki．jnwafu．2014．06．011网络出版地址：http：／／www．cnki．net／kcms／doi／10．13207／j．cnki．jnwafu．2014．06．011．html草鱼L基因的克隆及表达研究李超，刘品，曹艳姿，吉红，林亚秋(1西北农林科技大学动物科技学院，陕西杨凌712100；2西南民族大学

2、生命科学与技术学院，四川成都610041)[摘要]【目的】克隆草鱼肝x受体d亚型(LiverXReceptor，LXR~)cDNA序列，分析其在草鱼不同组织中的表达情况及n一3HUFA对草鱼肝胰脏LXRa基因表达的影响。【方法】以草鱼肝胰脏组织为材料，采用RT—PCR技术对其LXRa基因cDNA进行克隆分析，运用生物信息学的方法分析该基因序列同源性。检测LxR基因在草鱼1O种组织中的表达情况。以含0．52n-3HUFA的饲料饲喂草鱼95d后，用实时定量PCR法检测r卜3HUFA对肝胰脏LxRa表达的影响。【结果】克隆得到了草鱼LxR口eDNA序列(GenBank注册号为：FJ9

3、65309)，其ORF序列长度为1230bp，编码409个氨基酸，预测该蛋白分子式为CHss。Nss0⋯s分子质量为47263．7u，等电点pI为7．91，半衰期为30h。该蛋白质具有哺乳动物的LXRS特征：包括DNA结合位点(DBD)、P—box，配体结合域(LBD)、激活功能一2(AF_2)区域、D-box、D区域(Dregion)和属于2个锌指结构的8个半胱氨酸；与其他物种LXRa的同源性为70．7～100，其中与鲤鱼和斑马鱼的同源性分别达100和94．6。LXRa基因在草鱼肝胰脏、肌肉、心脏、鳃、精巢、肾脏、脑、脾脏、肠、腹腔脂肪等1O种组织中均有表达，其中在精巢中表达

4、水平最高(P

5、rasscarp(CtenopharyngodonMe／／as)LIChao，LIUPin，CAOYah—zi，JIHong，LINYa—qiu(1CollegeofAnimalScienceandTechnology，NorthwestA&FUniversity，Yangling，Shaanxi712100，China；2CollegeofLifeScienceandTechnology，SouthwestUniversityforNationalities，Chengdu，Sichuan610041，China)Abstract：[ObjectivelThisstudyob

6、tainedLiverXReceptor0t(LXRa)genecDNAsequenceofgrasscarp(C0口rg00idellas)，evaluateditsexpressionindifferenttissuesofLXRa，andanalyzedtheeffectofn一3HUFAonmRNAexpressionofLXRa．【MethodlThecDNAsequenceofLXRwasclonedfromhepatopancreasofgrasscarp．Thesequencehomologyofclonedgenewasanalyzedbybioinforma

7、ticmethods．AndthemRNAexpressionlevelsofLXR0：in10differenttissueswereanalyzedbysemi—quantita—tirePCR．Theeffectofn一3HUFAonmRNAexpressionofLXRawasevaluatedaftera95一dayfeedingtrailofdietwith0．52n一3HUFAbyqRT-PCR．[ResultlThecDNAsequenceofLXRawasobtained(