舌癌患者p16基因启动子CpG岛甲基化及其与临床病理的关系.pdf

舌癌患者p16基因启动子CpG岛甲基化及其与临床病理的关系.pdf

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1、广东医学2015年1月第36卷第1期GuangdongMedicalJourn~Jan.2015,Vo1.36.No.1·97·舌癌患者pl6基因启动子CpG岛甲基化及其与临床病理的关系米林曦,黄旋平,吴忆霖,徐华生广西医科大学附属口腔医院口腔颌面外科(南宁530021)【摘要】目的研究舌癌与pl6基因启动子区域的CpG岛甲基化的潜在关系,并了解pl6基因甲基化与临床病理的关系。方法观察组舌癌标本及对照组正常舌组织标本所提取的DNA,经亚硫酸氢钠处理改变甲基化碱基,设计相应引物(pl6一M、p16一u)Q—MSP扩增,检测样本中的甲基化比例。结果观察组甲基化阳性率为64.5

2、8%(31/48),对照组阳性率仅2.08%(1/48),差异有统计学意义(P<0.05);舌癌个体中pl6基因甲基化比例与病理分期、发生淋巴转移、组织学分化程度相关,与年龄、性别无关。结论pl6基因启动子CpG岛甲基化现象与舌鳞癌的发生发展关系密切;癌症发展越晚期、肿瘤浸润更深、发生转移、更低分化者p16基因启动子CpG岛甲基化的频率更高,但与患者年龄、性别等因素无关。【关键词】舌鳞癌;pl6基因;甲基化;临床病理研究表明,肿瘤抑制基因的CpG序列发生甲基化稀释倍数,数据与分析仪结果核对,确认操作液浓度。可能导致基因失活,pl6基因作为抑癌基因的一种,其1.3亚硫酸氢钠处

3、理DEPC处理水调配总含量为2启动子CpG岛甲基化引起的基因失活将会导致D1蛋g的各份DNA样品液。按照EZDNAMethylation—白表达过度,致使pRb磷酸化,游离DNA合成转录因GoldKit(ZYMO)说明调配液态CTConversionReagent,子E2F激活,从而反复进入有丝分裂期导致恶性增殖,每PCR管中加入130IxL的CTConversionReagent和增加癌变的可能。既往国内外关于舌癌与pl6基因甲2OIxLDNA样品,如DNA样品体积小于20L,则用水基化专项研究鲜见,且对与舌癌相关的主要基因异变来补差。经变温水浴解链,用Zymo—Spin

4、ICColumn类型暂无定论。本研究采用甲基化特异聚合酶链反应过滤管在10000r/min离心下依次过滤与试剂反应的(methylationspecificPCR,MSP)的荧光改进方法Q—DNA样品,最终所得亚硫酸氢钠处理的DNA样品投入MSP以提高结果的准确性和可观性,并对舌癌中甲基下一步骤实验使用。化比例与临床病理参数的相关性进行了分析,意在弥1.4引物设计OligoPrimerAnalysis软件设计pl6补国内外该领域研究的空白区。基因甲基化后相应引物(Primerpl6一M)与pl6基因未1资料与方法发生甲基化的相应引物(Primerpl6一U)。pl6一M正义

5、链引物序列:5一1-rA,rrAcAGGGTGGGGcGGATcGc一1.1一般资料观察组均来自于广西医科大学附属3,反义链序歹0:5一GACCCCGAACCGCGACCGTAA一口腔医院行手术治疗并常规病理切片检查确诊为舌鳞3;pl6一U正义链引物序列:5一TI'ATrAGAGGGT-状细胞癌的癌组织标本48例,患者年龄36~70岁,平GGGGTGGAT]'GT一3,反义链序列:5一CAACCCCAAA—均(45.3±1.75)岁,其中男24例,女24例。组织学分CCACAACCATAA一3。化程度:高分化30例,中分化15例,低分化3例。对1.5Q—MSP20的PCR反

6、应体系包括SYBR照组为来自舌外伤后所取及舌黏液囊肿患者中患区边PremixExTaq(2×)10L,特异性引物m的上游序列缘正常舌组织共48例,其中舌外伤来源22例,舌黏液和下游序列各0.4txL(甲基化体系)或特异性引物u囊肿旁正常舌组织26例(标本采集取得患者同意)。的上游序列和下游序列各0.4fxL(非甲基化体系),1.2提取组织DNA试剂取观察组及对照组的舌癌dHO7.2txL。配好的PCR反应液每孔分装18,按组织或者正常舌组织3g,置研钵于液氮中磨碎处理成顺序加标本DNA液各2IxL。置StepOne荧光PCR扩液,10000r/min离心1min,倒上清液留

7、底液,底液按增仪上,反应条件95cI=预变性10S,95℃变性5S,65℃试剂盒TIANampGenomieDNAKit说明提取DNA。提退火/延伸20S,40循环。各组均加入阴性对照,阴性取物经核酸分析仪NANODrop2000测定OD值,该值在体系未加入DNA。1.7~1.9之间,据公式DNA浓度(ng/IxL)=Am×50×1.6统计学方法采用SPSS19.0统计软件,观察广西医疗卫生重点科研课题资助项目(编号:桂卫重2011033)组、对照组、阴性对照组在荧光PCR仪上定性检测观广西高校科学技术研究项目(编

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