基于线粒体 COI 基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类.pdf

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1、第44卷第5期淡水渔业2014年9月Vo1．44No．5FreshwaterFisheriesSep．2014基于线粒体CO1基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类于亚男，宋超，侯俊利，王妤，庄平(1．南京农业大学无锡渔业学院，江苏无锡214182；2．中国水产科学研究院东海水产研究所，上海200090)摘要：对采白长江口的7种虾虎鱼(Gobiidae)19个个体的线粒体CO1基因进行测序，其他6种虾虎鱼的相应序列从Genbank中获得。序列分析结果显示7种虾虎鱼的COl基因部分序列密码子的第一位碱

2、基的GC碱基含量最恒定，第三位碱基的GC含量最高，平均A+T的含量要高于G+c的含量，与多种鱼类的COl基因的碱基特点相似。运用MEGA5．0计算13种虾虎鱼的种问遗传距离，表明拉氏狼牙虾虎鱼(Oxyurichthytentacularis)与孔虾虎鱼(Chaeturichthysstigmatias)归属于近盲虾虎鱼亚科，根据种间遗传距离与系统发育树的结构特征推测，触角沟虾虎鱼和矛尾虾虎鱼可能具有共同的起源。关键词：虾虎鱼科；线粒体细胞c亚基(CO1)；分子系统分类中图分类号：$917．4文献标识码

3、：A文章编号：1000—6907一(2014)05-0003-06SystemclassificationforGobiidaederivedfromtheYangtzeRiverbasedonmitochondrialCO1genepartialsequenceYUYa．nan，SONGChao，HOUJun．1．i．，WANGYu，ZHUANGPing，(1．WuxiFisheriesCollege，NanjingAgriculturalUniversity，Wuxi214182，Jiangsu，

4、China；2．EastChinaSeaFisheriesResearchInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Shanghai200090，China)Abstract：AtotalofnineteenspecimensofsevenspeciesofGobiidaedelvedfromtheYangtzeRiverwerecouectedtose—quencemitoehondriMCOIgenes．Sequencesfromhomologousreg

5、ionsofsixotherspeciesofthisfamilyweregatheredfromGenbank．TheresultsshowedthatthemostconstantGCcontentwasinthefirstbaseofcodonandthehighestGCcontentexistedinthethirdbaseofcodon．TheaveragecontentofA+TwashigherthantheaveragecontentofG+C．Thefeaturewassimila

6、rtomostfishes．ComparingtheCO1geneofthiaeenspeciesofGobiidaewithMEGA5．0，thetaxonomicstatusofOdontamblyopnslacepediiandTrypauchenvaginawereprovedlegitimately．ThegeneticdistancebetweenspeciesandthestructurefeatureofPhylogenytreeindicatedthesameoriginofOxyu

7、richthytentacularisandChaeturichthysstigmatias．Keywords：Gobiidae；cytochromeoxidasesubunitI(CO1)gene；molecularsystemclassification虾虎鱼科(Gobiidae)隶属鲈形目，是中华鲟幼码基因之一，中度保守，既能保证足够的变异又易鱼索饵洄游的主要饵料生物，以钩虾、枝角类、于被通用引物扩增，且很少存在插人与缺失，可用桡足类等为食，是水域生态系统中物质循环和能量于种问及种以上阶元的分析

8、。长江口水域环境传递的重要一环，在长江口生态系统中具有重复杂多变，分布的虾虎鱼科常见种类有10种左要地位。CO1基因是鱼类线粒体13个蛋白质编右，以CO1基因对其进行系统分类及进化关系收稿日期：2014—02—28；修订日期：2014—05—21资助项目：长江水环境教育部重点实验室开放课题(YRWEE201106)；公益性行业(农业)科研专项(201203065)；长江口中华鲟自然保护区专项；上海市青草沙水库l临近水域生态修复专项第一作者简介：于亚男(1