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《2种虾虎鱼细胞色素b基因全序列克隆与分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第6卷第5期南方水产Vol.6,No.52010年10月SouthChinaFisheriesScienceOct.,2010doi:10.3969/j.issn.1673-2227.2010.05.0072种虾虎鱼细胞色素b基因全序列克隆与分析陈雷,程远志,王日昕,徐田军(浙江海洋学院海洋科学学院,海洋生物资源与分子工程实验室,浙江舟山316000)摘要:测定了矛尾刺虾虎鱼(Acanthogobiushasta)和红狼牙虾虎鱼(Odontamblyopusrubicundus)的线粒体细胞色素b(Cytb)基因全序列。
2、2种虾虎鱼Cytb基因序列全长均为1141bp,通过序列比对,检测到266个变异位点,序列中碱基转换频率高于颠换,碱基替换主要发生在密码子第3位。结合GenBank中的虾虎鱼科其他物种的细胞色素b基因全序列,利用Kimura-双参数模型分析遗传距离表明,10种虾虎鱼科鱼类的遗传差异在0.118～0.330之间,大头新虾虎鱼(Neogobiuskessleri)与同属的裸喉新虾虎鱼(N.gymnotrachelus)遗传距离最小,为0.118;大头新虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼遗传距离最大,为0.330。以Cytb基因全序列构建的
3、NJ进化树分析表明,10种虾虎鱼分为3个主要类群,红狼牙虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼聚为1支,且与其余8种虾虎鱼类遗传距离较远。关键词:虾虎鱼科;细胞色素b;序列分析;系统发生+中图分类号:Q532.8文献标志码:A文章编号:1673-2227-(2010)05-0043-07CloningandsequenceanalysisofCytbgenein2GobiidaefishesCHENLei,CHENGYuanzhi,WANGRixin,XUTianjun(Lab.forMarineLivingResourcesandMol
4、ecularEngineering,CollegeofMarineScience,ZhejiangOceanUniversity,Zhoushan316000,China)Abstract:ThecompletesequencesofCytbgenesinAcanthogobiushastaandOdontamblyopusrubicunduswereamplified,clonedandsequenced.TheCytbgenesinbothspeciesare1141bpinlength.Comparingtheob
5、tainedsequences,wedetected266nucleotiderdvariationsites,findingmoretransitionsthantransversions.Mostbasesubstitutionsoccuratthe3locusofthecodon.BasedonthecompleteCytbsequencesofGobiidaefishesrecordedinGenBank,thegeneticdistanceamong10GobiidaespeciescalculatedbyKi
6、mura-2parametersmodelrangesfrom0.118to0.330.ThedistancebetweenNeogobiuskessleriandN.gymnotrachelusistheshor-test,being0.118,whilethedistancebetweenN.kessleriandA.hastaisthefarthest,being0.330.ThephylogeneticanalysisbasedonCytbgenesequenceusingNJmethodsuggeststhat
7、the10Gobiidaefishesaredividedinto3maingroups.Specifically,O.rubicundusandA.hastaclusterintooneclade,havingarelativefargeneticdistancetotheother8Gobiidaespecies.Keywords:Cobiidae;Cytb;sequenceanalysis;phylogeny鱼类是脊椎动物中较原始而种属数量又占优势分子技术向生物学各研究领域的渗透,从分子水平的类群,其物种繁多,遗传
8、背景复杂,研究其系统上研究鱼类的遗传与进化,已经受到极大的关注。发生,阐明其进化途径,一直是研究的热点。随着鱼类线粒体DNA(mtDNA)与其他脊椎动物的收稿日期:2010-05-14;修回日期:2010-06-05资助项目:国家科技支撑计划项目(2007BAD43B08);浙江省重大科研项目(2007C02001)
