两种虾虎鱼cytb基因序列分析【毕业论文】

《两种虾虎鱼cytb基因序列分析【毕业论文】》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、本科毕业论文目录本科毕业论文（20届）两种虾虎鱼cytb基因序列分析专业：生物科学本科毕业论文目录目录摘要I引言11材料与方法31.1材料31.1.1样本采集31.1.2主要仪器与设备31.1.3主要试剂41.1.4主要试剂的配制41.2实验方法61.2.1基因组DNA提取61.2.2PCR扩增和产物电泳检测61.2.3产物纯化以及克隆测序71.2.4数据处理与系统关系发生分析72结果与分析82.1Cytb基因碱基组成与特征82.2Cytb基因密码子使用情况92.310种虾虎鱼类遗传距离103讨论123.1虾虎鱼科系统进化分析123.2虾虎鱼mtDNA-cytb研究现状123.3线

2、粒体cytb的用途13参考文献15致谢35本科毕业论文中文摘要摘要[摘要]测定了矛尾刺虾虎鱼以及红狼牙虾虎鱼的线粒体细胞色素b基因全序列。2种虾虎鱼cytb基因序列全长均为1141bp，通过序列比对，检测到266个变异位点，序列中碱基转换频率高于颠换，碱基替换主要发生在密码子第三位。结合GenBank中的虾虎鱼科其他物种的细胞色素b基因全序列，利用Kimura-双参数模型分析遗传距离表明，10种虾虎鱼科鱼类的遗传差异在0.118~0.330之间，大头新虾虎鱼与同属的裸喉新虾虎鱼遗传距离最小，为0.118；大头新虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼遗传距离最大，为0.330。以cytb基因全序列构建

3、的NJ进化树分析表明，10种虾虎鱼分为三个主要类群，红狼牙虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼聚为一支，且与其余8种虾虎鱼类遗传距离较远。[关键词]矛尾刺虾虎鱼；红狼牙虾虎鱼；细胞色素b；序列分析；系统发生15本科毕业论文中文摘要15本科毕业论文英文摘要15本科毕业论文英文摘要Abstract[Abstract]ThecompletesequencesofcytbgenesinAcanthogobiushastaandOdontamblyopusrubicunduswereamplified,clonedandsequenced.Thecytbgeneineachspecieswas1141bpi

4、nlength.Comparingobtainedsequences,266nucleotidevariationsitesweredetected.Transitionswereobservedtomorethantransversions,andmostofthebasesubstitutionsoccurredatthethirdlocusofthecodon.IncombinationwithcompletecytbsequencesofGobiidaefishesrecordedinGenBank，thegeneticdistanceamong10Gobiidaespec

5、iescalculatedbyusingkimura-2parametersmodelrangedfrom0.118to0.330.TheshortestdistanceoccurredbetweenNeogobiuskessleriandNeogobiusgymnotrachelus,being0.118,whilethelongestonebetweenN.kessleriandA.hasta,being0.330.ThephylogeneticanalysisbasedoncytbgenesequenceusingNJmethodsuggestedthatthe10Gobii

6、daefishesweredividedintothreemaingroups,O.rubicundusandA.hastaweremergedintoaclade，andhadarelativefargeneticdistancetotheother8speciesofGobiidae.[Keywords]Cobiidae；cytb；sequenceanalysis；phylogeny15本科毕业论文引言引言鱼类是脊椎动物中较原始而种属数量又占优势的类群，其物种繁多，遗传背景复杂，研究其系统发生，阐明其进化途径，一直是研究的热点。随着分子技术向生物学各研究领域的渗透，从分子水平上

7、研究鱼类的遗传与进化，已经受到极大的关注。鱼类线粒体DNA（mtDNA）与其他脊椎动物的mtDNA一样，呈共价闭合环状，包括一条轻链，一条重链，是细胞核外具有自主复制、转录和翻译能力的遗传因子。与核DNA相比，鱼类线粒体DNA具有分子小、结构简单、进化速度快、不同区域进化速度存在差别等特点，是一个相对简单的复制单位，成为研究鱼类群体遗传结构与系统演化关系的重要分子标记[1-5]。虾虎鱼，属鲈鱼目，虾虎鱼亚目。其特点是身体细长，有两条脊鳍。第一条有几根细微的脊骨，头部和