基于线粒体COI基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类

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1、第44卷第5期淡水渔业2014年9月Vol.44No.5FreshwaterFisheriesSep.2014基于线粒体COI基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类1，22221，2于亚男，宋超，侯俊利，王妤，庄平(1.南京农业大学无锡渔业学院，江苏无锡214182;2.中国水产科学研究院东海水产研究所，上海200090)摘要:对采自长江口的7种虾虎鱼(Gobiidae)19个个体的线粒体COI基因进行测序，其他6种虾虎鱼的相应序列从Genbank中获得。序列分析结果显示7种虾虎鱼的COI基因部分序列密码子的第一位碱基的GC碱基含量最

2、恒定，第三位碱基的GC含量最高，平均A+T的含量要高于G+C的含量，与多种鱼类的COI基因的碱基特点相似。运用MEGA5.0计算13种虾虎鱼的种间遗传距离，表明拉氏狼牙虾虎鱼(Oxyurichthytentacularis)与孔虾虎鱼(Chaeturichthysstigmatias)归属于近盲虾虎鱼亚科，根据种间遗传距离与系统发育树的结构特征推测，触角沟虾虎鱼和矛尾虾虎鱼可能具有共同的起源。关键词:虾虎鱼科;线粒体细胞C亚基(COI);分子系统分类中图分类号:S917.4文献标识码:A文章编号:1000-6907-(2014)05-0

3、003-06DOI:10.13721/j.cnki.dsyy.2014.05.001SystemclassificationforGobiidaederivedfromtheYangtzeＲiverbasedonmitochondrialCOIgenepartialsequence1，22221，2YUYa-nan，SONGChao，HOUJun-li，WANGYu，ZHUANGPing(1.WuxiFisheriesCollege，NanjingAgriculturalUniversity，Wuxi214182，Jiangsu，Chi

4、na;2.EastChinaSeaFisheriesＲesearchInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Shanghai200090，China)Abstract:AtotalofnineteenspecimensofsevenspeciesofGobiidaederivedfromtheYangtzeＲiverweresequencedmito-chondrialCOIgenes．Sequencesfromhomologousregionsofsixotherspeciesofthisf

5、amilyweregatheredfromGenbank．TheresultsshowedthatthemostconstantGCcontentwasinthefirstbaseofcodonandthehighestGCcontentexistedinthethirdbaseofcodon．TheaveragecontentofA+TwashigherthantheaveragecontentofG+C．Thefeaturewassimi-lartomostfishes．ComparingtheCOIgeneofthirteensp

6、eciesofGobiidaewithMEGA5.0，thetaxonomicstatusofOdont-amblyopuslacepediiandTrypauchenvaginawereprovedlegitimately．Thegeneticdistancebetweenspeciesandthestruc-turefeatureofPhylogenytreeindicatedthesameoriginofOxyurichthytentacularisandChaeturichthysstigmatias．Keywords:Gobi

7、idae;cytochromeoxidasesubunitI(COI)gene;molecularsystemclassification虾虎鱼科(Gobiidae)隶属鲈形目，是中华鲟幼码基因之一，中度保守，既能保证足够的变异又易［1］鱼索饵洄游的主要饵料生物，以钩虾、枝角类、于被通用引物扩增，且很少存在插入与缺失，可用［4］桡足类等为食，是水域生态系统中物质循环和能量于种间及种以上阶元的分析。长江口水域环境［2］传递的重要一环，在长江口生态系统中具有重复杂多变，分布的虾虎鱼科常见种类有10种左［3］［5］要地位。COI基因是鱼类线粒

8、体13个蛋白质编右，以COI基因对其进行系统分类及进化关系收稿日期:2014－02－28;修订日期:2014－05－21资助项目:长江水环境教育部重点实验室开放课题(YＲWEE201106);公益性行业(农