基于线粒体coi基因研究松毛虫部分种类亲缘关系

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1、分类号Q963密级公开UDC学位论文基于线粒体COI基因研究松毛虫部分种类亲缘关系PhylogeneticrelationshipresearchofsomespeciesofpinecaterpillarsbasedonmtDNA-COIgene贾玉迪指导教师姓名孔祥波副研究员申请学位级别硕士专业名称森林保护学研究方向昆虫分子生态论文提交日期2011年5月论文答辩日期2011年6月学位授予日期2011年7月答辩委员会主席李镇宇评阅人北京·中国林业科学研究院万方数据学位论文基于线粒体COI基因研究松毛虫部分种类亲缘关系学位论文作者贾玉迪指导教师姓名孔祥波副研究员指导小

2、组成员张真研究员王鸿斌副研究员申请学位级别硕士专业名称森林保护学研究方向昆虫分子生态论文答辩日期2011年6月20日中国·北京万方数据DissertationfortheDegreePhylogeneticrelationshipresearchofsomespeciesofpinecaterpillarsbasedonmtDNA-COIgeneCandidate:JiaYudiSupervisor:KongXiangboAssociateSupervisor:ZhangZhenWangHongbinAcademicDegreeAppliedfor:MasterSpe

3、ciality:ForestProtectionDateofDefence:June.2011Degree-Conferring-Institution:ChineseAcademyofForestry万方数据匿名评阅论文论文编号中国林科院硕士学位论文题目：基于线粒体COI基因研究松毛虫部分种类亲缘关系EnglishTitle:PhylogeneticrelationshipresearchofsomespeciesofpinecaterpillarsbasedonmtDNA-COIgene专业：森林保护学学位论文答辩预定日期：2010年6月日通讯地址：北京颐和园后中

4、国林科院研究生院，100091联系电话：010-62888546；传真：010-62889029电子邮址：05zhangjinyu@163.com万方数据独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得本研究生培养单位或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：日期：年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解中国林业科学研究院

5、有关保留、使用学位论文的规定，中国林业科学研究院有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权中国林业科学研究院可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签名：年月日年月日学位论文作者毕业联系方式工作单位：联系电话：电子邮件：通讯地址、邮编：VII万方数据摘要为了研究松毛虫属7个主要种类的系统发育和亲缘关系，作者总结了前人的研究方法，对近年来的技术进展和应用情况做了综述，并对7个种类的松毛虫线粒体COI基因

6、进行了测序。另外，对部分松毛虫线粒体基因COII、ND1、Cytb、16S和核糖体内转录间隔区ITS1和ITS2部分序列以及核基因延伸因子EF-1a进行了初步研究，结果如下：马尾松毛虫、油松毛虫、赤松毛虫和落叶松毛虫的线粒体COI基因部分序列均为636bp，碱基的平均频率为A=34.75%，T/U=34.75%，C=15.25%，G=15.25%。马尾松毛虫遗传多样性最高（核酸多样度为3.93%），落叶松毛虫最低（0.629%）。4种松毛虫间的遗传距离由远及近为落叶×赤（0.083）＞落叶×马尾（0.068）＞落叶×油（0.066）＞赤×油（0.057）＞马尾×赤（0

7、.054）＞马尾×油（0.012）。系统树上不能显著区分油松毛虫和马尾松毛虫，两者为同一物种。COI结果支持目前的分类系统。COI基因能够用于4种松毛虫之间的亲缘关系研究，适合作为种间的分子分类标记应用于松毛虫属昆虫分类鉴定。利用COI序列推测马尾松毛虫、文山松毛虫、油松毛虫、赤松毛虫、落叶松毛虫、思茅松毛虫和云南松毛虫的进化顺序。经过替代模型和参数筛选，最佳模型和参数为T92+G(Tamura3-parameter)。将黄褐天幕毛虫作为外群，用MEGA5.0软件分别使用NJ和MP方法构建系统发育树，结果显示两个系统树是一致的。7种松毛虫形成两个分支