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《H9亚型禽流感病毒SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR法检测方法的建立-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、青岛农业大学学报(自然科学版)30(3):195~199,2013JournalofQingdaoAgriculturalUniversity(NaturalScience)文章编号:1674—148X(2013)03—0195一O5H9亚型禽流感病毒SYBRGreenI荧光定量RT—PCR法检测方法的建立徐守振,尹燕博(青岛农业大学动物科技学院,山东青岛266109)摘要:RT—PCR扩增H9亚型禽流感病毒(AIV(H9))的HA基因保守片段,将其克隆到pMD18一T载体,经测序验证正确作为阳性质粒。以阳性质粒为标准品,建立SYBRGree
2、nI荧光定量RT—PCR的标准曲线。结果表明,该方法灵敏性可达74.3copies/~L,且特异性好、重复性佳。SYBRGreenI实时荧光定量RT—PCR方法为H9亚型禽流感的病原的快速诊断和病毒的定量分析提供重要手段。关键词:H9亚型禽流感病毒;HA基因;SYBRGreenI荧光定量PCR中图分类号:$852.65文献标识码:ADOI:10.3969/J.ISSN.1674—148X.2013.03.009EstablishmentofSYBRGreenIReal-timeRT—PCRDetectingH9AvianInfluenzaVi
3、rusXUShouzhen。YINYanbo(CollegeofAnimalScienceandVeterinaryMedicine,QingdaoAgriculturalUniversity,Qingdao266109,China)Abstract:ConservativefragmentofHAgeneofAIV(H9)wasamplifiedbyRT—PCRandclonedintopMD18一Tvector.Aftersequencing,thepositiverecombinantplasmidwasacquiredandusedt
4、oestablishstandardcurveoftheSYBRGreenIreal—timeRT-PCR.Theresultsshowedthatthesensitivitywassogoodthat74.3copies/~Loftheviruscontentcouldbedetected.Furthermore,thismethodwashighlyspe—cificandreproducible.ItisconcludedthattheSYBRGreenIreal—timeRT—PCRisagoodtechnologyforpathog
5、enicdiagnosisandvirusquantificationofAIV(H9).Keywords:H9N2avianinfluenzavirus;HAgene;SYBRGreenIReal—timeRT—PCR禽流感(avianinfluenza,AI)是由于正黏病毒科养禽生产造成的巨大影响和损失,如何快速准确地流感病毒属的A型流感病毒(AIV)引起的一种禽检测AIV(H9)已成为防控的关键。类或人类感染的传染病。根据AIV的血凝素(HA)禽流感AI(H9)与新城疫(ND)、鸡传染性支气和神经氨酸酶(NA)抗原差异,AIV可分为16
6、个管炎(IB)临床症状相似,给AI(H9)的诊断造成了HA亚型(H1~H16)和9个NA亚型(N1~极大困难。传统的病毒分离和血清学诊断方法费时N9)口]。H9亚型AIV(AIV(H9))于1966年在美费力,不利于AIV(H9)的快速诊断;而常规RT—国威斯康星在火鸡中首次发现,自1999年以来也出PCR方法由于实验室污染等原因存在一定的假阳现AIV(H9)多次感染人的报道。目前,AIV(H9)性,且不能对病毒进行定量分析_3]。近年发展起来在我国广泛存在,可引起雏鸡死亡,生产性能下降,的实时荧光定量PCR(Real-timePCR)技术以
7、其快常与其他病原(如大肠杆菌)混合感染,给养禽业造速简单、高度灵敏和强特异性等优点广泛应用到基成严重经济损失I2]。鉴于AIV(H9)对人类健康和因表达分析,并引用到AIV的定性和定量检收稿日期:2013—07—09基金项目:青岛市公共领域科技支撑计划(10-3-3—17一nsh);山东省现代农业产业技术体系家禽创新团队项目作者简介:徐守振(1977一),男,山东沂水人,副教授,博士,主要从事禽病防治研究。青岛农业大学学报(自然科学版)测[4],但Real—timePCR方法用于检测AIV(H9)10×Buffer3肚L,MgC123L,dN
8、TP(10mmol/L)临床样品的研究很少。本试验旨在建立快速检测临2.5FL,rTaq酶0.5FL,上下游引物各0.5FL,反转床病料中AIV(H9)的SYBRG
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