浙江省209株沙门菌PFGE指纹图谱研究.pdf

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1、2478中国卫生检验杂志2009年11月第19卷第11期ChineseJournalofHealthLaboratoryTechnology,Nov2009;Vol19No11【论著】浙江省209株沙门菌PFGE指纹图谱研究梅玲玲,罗芸,叶菊莲,朱敏,张俊彦,潘军航,龚璞,杨婷婷(浙江省疾病预防控制中心,杭州310051)[摘要]目的:建立浙江省沙门菌PFGE指纹图谱资料库,为查明沙门菌食源性疾病污染源,确定各病例之间的病原学关系,及时处理大范围内呈散发特征的沙门菌事件提供科学依据。方法:收集、提取全省历年来在各类食品和腹泻病人中分离的209株沙门菌的DNA,用限制性内切酶Xbal切割,脉

2、冲场凝胶电泳(PFGE)技术建立PFGE指纹图谱,用BioNu2mericsV511软件UPGMA方法进行聚类分析。结果:209株沙门菌分成10个基因型别160种PFGE基因指纹图谱。其中67株德尔卑沙门菌可分为6个型别35种PFGE指纹图谱,主要集中在1个PFGE指纹图谱型别中。14株肠炎沙门菌分属3个型别8种PFGE指纹图谱,相似系数在01800~11000之间。鼠伤寒沙门菌间的PFGE指纹图谱差异较大。结论:PFGE指纹图谱与血清学型别无相关性,该方法在研究沙门菌分子流行病学、确定各病例之间的病原学关系效果良好。[关键词]沙门菌;脉冲凝胶电泳;PFGE指纹图谱+[中图分类号]R378

3、122[文献标识码]A[文章编号]1004-8685(2009)11-2478-05PFGEfingerprintanalysisof209SalmonellastrainsinZhejiangProvinceMEILing2ling,LUOYun,YEJu2lian,ZHUMin,ZHANGJun2yan,PANJun2hang,GONGPu,YANGTing2ting(ZhejiangCenterforDiseaseControlandPrevention,Hangzhou310051,China)[Abstract]Objective:ToestablishthePFGEfinger

4、printdatabankofSalmonellainZhejiangprovinceandprovidescientificevidencestopollutionsourcesurveytofindouttherelationshipofpatientsandresolvetheextensivesporadiccases1Methods:DNAcollectedfrom209strainswhichwereseparatedfromfoodanddiarrheapatientsinprovincethroughyears,digestedDNAbyXbaIandestablished

5、thefingerprintdatabank,clusteringanalysisbyBioNumericsV5111Results:209strainsofSalmonellawereclassifiedas10genetypesand160PFGEfingerprinttypes167strainsofSalmonellaDerbywereclassifiedas6genetypesand35PFGEfingerprinttypes,mostofthemwerethesamegenetype114strainsofSalmonellaEnteritidiswereclassifieda

6、s3genetypesand8PFGEfingerprinttypes,thesimilaritycoefficientwasbetween01800to110001PFGEfingerprintofSalmonellaTyphimuriumwerevariant1Conclusion:PFGEfingerprinttypesarenotrelativelywithsetotypes,theresultsofPFGEaregoodatmolecularepi2demiologyanalysisandfindingouttherelationshipbetweencases1[Keyword

7、s]Salmonella;PFGE;Fingerprint沙门菌为国内外主要食源性致病菌。该菌广泛存在于自食源性致病菌的PFGE分子分型快速标准化规程,并建立细菌[1]然界,至今已经发现的血清型就高达2463个。目前,多数分子分型国家电子网络(PlalseNet)。美国各个州的公共卫生实验室对沙门菌间的同源性鉴别主要采用血清分型方法,该实验室通过该网络,可以快速将来自当地病人或可疑食品样方法虽然有简便、易操作等优点,但只

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