波纹唇鱼(Cheillinus undulatus)不同地理种群遗传多样性的微卫星分析.pdf

波纹唇鱼(Cheillinus undulatus)不同地理种群遗传多样性的微卫星分析.pdf

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1、第31卷第4期2013年10月海洋科学进展ADVANCES1NMARINESCIENCEV01.31NO.4October,2013波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)不同地理种群遗传多样性的微卫星分析胡静1’2,侯新远1,尹绍武1,祝斐1,贾一何1,胡亚丽1(1.南京师范大学生命科学学院,江苏南京210023;2.中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,广东广州510300)摘要:以海南陵水海域、马来西亚海域、西沙海域、南沙海域四个不同地理群体的波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)为研究对象,

2、利用微卫星(SSR)分子标记技术对其群体遗传多样性进行分析。研究结果表明,15对微卫星引物在4个群体中共检测到246个等位基因;期望杂合度、观测杂合度、多态信息含量、Shannon's信息指数结果在4个群体中均以马来西亚群体为最高,分别为0.736、0.531、0.696和1.705;聚类分析结果显示波纹唇鱼的4个群体明显地聚为2支,马来西亚群体、海南陵水群体和西沙群体聚为1支,南沙群体独立1支;AM()VA分子方差分析结果显示,波纹唇鱼60.90%的遗传变异来自于个体间,35.75%的遗传变异来自于群体内个体间,仅有4.15%的遗

3、传变异来自于群体间;群体遗传分化系数F。为0.3730,群体间基因流Nm为0.8405。本研究显示波纹唇鱼种群具有较高遗传多样性水平,群体间存在较大程度的遗传分化。关键词:波纹唇鱼;遗传多样性;微卫星中图分类号:X834文献标识码:A文章编号:16716647(2013)04-053808波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)俗名苏眉,在分类学上隶属鲈形目(Perciformes)、隆头鱼科(Labridae)、唇鱼属(Cheilinus),是一种暖水性鱼类,同时也是体型最大的珊瑚礁鱼类之一。分布于非洲东岸、红海以及印度洋

4、至太平洋中心,在我国主要分布于南海与东海的南部海域以及台湾海域[1。]。波纹唇鱼为名贵的海水经济鱼类,其肉质细嫩味鲜,营养价值高,深受亚洲人喜爱[州。因过度捕捞及珊瑚礁栖息地破坏等因素,导致自然海区的波纹唇鱼数量越来越少,目前已濒临灭绝。1996—2005年间波纹唇鱼曾4度被世界自然保护联盟(IUCN)、世界自然基金会(WWF)等组织和《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES)列入濒危物种名单。因此,应加大对其野生资源的保护力度,同时加强和加快对其种质资源的研究,以期对其进行更加合理的开发和保护。目前,国内外有关波纹唇鱼的研究报

5、道较少,多集中在该鱼生物学研究方面∞。8j,而国内仅见对其消化系统组织学研究¨]、不同组织同工酶表达差异研究¨o]、核型分析¨1J、营养成分分析¨23以及鳃丝结构观察¨副等方面报道,未见关于该鱼种质资源方面的研究。近年来,微卫星分子标记技术被广泛应用于物种进化、生物群体内的遗传变异、遗传多样性分析、遗传图谱构建以及种问关系甚至生物个体鉴别等领域[1“。本研究采用微卫星分子标记技术对波纹唇鱼4个野生群体进行遗传多样性分析,旨在为波纹唇鱼这一濒危物种的保护生物学和资源开发提供更多基础资料。收稿日期:201303—19资助项目:国家自然科

6、学基金项目波纹唇鱼种质资源的分子遗传多样性研究(40966003);“I‘一五”国家科技支撑计划重点项目南海区主要养殖种类种质保存及评价技术(2007BAl)29803)作者简介:胡静(1987一),女,湖北省武汉人.硕士研究生,主要从事鱼类种质资源与遗传育种方面研究.E—mail:hijklnml23@sina.coFn*通讯作者:Email:yinshaowu@163.com(王佳实编辑)4期胡静,等:波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)不同地理种群遗传多样性的微卫星分析5391材料与方法1.1实验材料野生波纹唇鱼共

7、101尾分别取自海南陵水、马来西亚、西沙以及南沙群岛附近海域,采样信息见表1。分别取尾鳍固定在95%乙醇中带回实验室,更换两次95%乙醇后置于--40℃保存备用。表1波纹唇鱼样品的基本信息Table1BasicinformationofCheilinusundulatussamples1.2引物合成从本实验室自主开发的波纹唇鱼微卫星引物中选取15对,并在5’端按照扩增目的片段大小分别标记了3种荧光染料:HEX、FAM及TAMRA,引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成,序列信息和退火温度等见表2。表215对微卫星引物信息Table2Th

8、einformationoffifteenmicrosatelliteprimers注:F为正向引物;R为反向引物540海洋科学进展31卷1.3基因组DNA的提取对常规“酚一氯仿”抽提法m3稍加改动,提取波纹唇鱼尾鳍基因组DNA,用1

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