利用aflp分析不同羊草种群间与种群内的遗传多样性

《利用aflp分析不同羊草种群间与种群内的遗传多样性》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、东北师范大学硕士学位论文基因组丰富度多态性水平检测基因组区可检测座位数可靠性遗传特性DNA质量要求序列信息放射性同位素实验周期开发成本中等很高高中等高中等单／低拷贝区14高共显性高5—30Ilg否通常用长高较高整个基因组1．10中显性／共显性中10·100ng否不用短低高非常高高非常高一列罾篙整篙因淼5．50FMc5·5020．100FMC不用长高不用长高显性／共显性很高50一100ng否可用较长高显性／共显性很高50一100ng否可用长高由于本论文主要应用了AFLP分子标记方法，因此以下将主要对AFLP标记技术的特点进行简要的介绍。AFLP

2、(缸npli丘ed￡．agmentlengthpolylno印llism)‘26J是在I江LP的基础上，类似毗心D的对基因组未知信息的前提下，形成的一种新的RFLP方法，即：扩增产物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离、染色，确定RFLP位点，省去了分子杂交及放射性标记等繁杂步骤。AfLP标记所检测的多态性与RFLP～样，是限制性酶切位点的变化或酶切片段的变化。因此，AFLP比RFLP和黜心D能提供更多的基因组信息。此外，AFLP标记稳定性强，重复性好，自动化程度高，标记呈显性或共显性，对DNA的数量及质量要求相对较低，并且可以通过控制引物的数目和种类

3、来选择扩增不同的DNA片段以及扩增的DNA片段的数目，因而在实际应用中有着非常好的前景，并得到了广泛的应用。虽然这种分子标记技术费用较高，技术要求严格。但与其优点比较来看，AFLP是目前被认为是分子标记技术中多态性最为丰富的技术之一。5显增乓ih高蛾性腑

4、霎否显熨显培高猷性中㈣否显¨：仝高跳中m强硐短高：仝高捌中～被硼短高东北师范大学硕士学位论文1．2羊草种群分子遗传学研究进展前人对羊草的分析遗传学研究主要集中在两个方面，一个就是对其自然种群的遗传多样性和种质资源的丰富程度的研究，另外就是对两种叶色的羊草种群遗传多样性的比较和彼此间的分化程度

5、的衡量。1．2．1羊草种群的遗传多样性和种质资源刘杰等(2002)利用AFLP分子标记方法对中国境内各个分布地区的27个羊草种群进行了该物种的种群种质多样性的研究【14】。他们发现所有种群的平均PIC指数达到O．216。结果证明了羊草基因组DNA存在大量的多态性位点。同时，他们指出不同生境中的差异性的生态因子，如：经纬度，土壤酸碱度，温度和日照等等，都会在羊草物种的形成过程中产生自然选择的压力。而其它的因素，如：自然突变，人工选择等等，会和以上生态因子一起作用，造成了羊草两种叶色种群的形成。胡宝忠【lo】(1988)应用黜圩D技术分析不同土壤

6、条件下羊草种群的遗传多样性，发现不同土壤上的灰色羊草种群间已经发生很大分化。Liu等【13】(2007)比较了中国境内的293个羊草种群的遗传多样性。他们利用各种数量和质量特征指数，分析了种群的遗传多样性指数(Sh锄onindex)，发现相比灰绿色羊草，黄绿色的羊草种群含有较少的遗传多样性(P

7、性。黄绿和灰绿两种类型间的遗传距离远大于地理距离较远的同类型的遗传距离。同样，他也得到了相似的遗传多样性方面的结果(利用黜心D标记)，即：灰绿型种群的遗传多样性远高于黄绿型种群。其总结了形态，蛋白质和DNA水平上的结果，最后得出：羊草已经分化成两种不同特征的生态型(黄绿和灰绿型)，而且羊草表型分化与基因型分化一致。6东北师范大学硕士学位论文二、AFLP分子标记分析羊草两种叶色的天然种群遗传多样性与遗传结构分化本章利用AFLP分子标记，研究了不同叶色羊草其自然种群和人工移栽后的种群的遗传多样性，彼此间遗传分化的程度，并分析了两种叶色的羊草其叶色

8、分化后的稳定性。所的到结论不仅在基础理论方面有着重大的意义，同时为实践中的羊草种群移栽提供了一定的理论依据。2．1材料和方法2．1．1材料本研究中选取了中国东北松嫩平原两个自然野生的羊草(三哪螂C厅栩伽西)种群和一个人工移栽的种群。前者包含一个灰绿色羊草种群(命名为GGLl，44。41’N，123。47’E，取自盐碱化的草甸，8．5

9、，44‘45’N，123‘45’E)，因此GGL2与YGL生长与相同的土壤和气候条件下。所有的GGLl采集个体都来源于当时GGL2移栽的区域。取样的原则是每个种群随