刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析

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1、上海水产大学硕士学位论文仿刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析摘要本研究以烟台、蓬莱、威海、大连4个地理种群及养殖和自然群体的仿刺参(又称刺参)为研究对象，采用RAPD和SSR两种分子标记对四个群体的遗传结构进行了研究。分析了刺参养殖群体和自然群体之间的遗传变异，以及四群体之间的遗传分化。主要结果如下：1．用经过筛选的9个微卫星座位对刺参养殖群体和自然群体进行扩增，每个座位检测到的等位基因数为4～12个。自然和养殖群体中，有效等位基因平均数分别为6．5556和5．8889，期望杂合度的平均值分别为0．7641和0．6941，观测杂合度的平均值分别为0．6416和0．5635。根据

2、群体中各座位等位基因频率计算出两群体间的遗传相似度为O．7970、遗传距离为0．2269。对两群体进行Hardy—Weinberg平衡检验发现，自然群体在位点脚1828、Psj2022、Psi2642，养殖群体在位点Psi2022，Psj2031，Psj2409，Psj2642，Psi2889都出现了杂合子缺失现象，特别是养殖群体在位点Psj2022，其Hardy-weinberg遗传偏离指数达0．5164。结果表明，与自然群体相比，刺参养殖群体存在杂合度降低，遗传多样性下降的现象，这可能与人工养殖过程中，群体较小，引起近交机会增加有关。应制定相应的渔业生产和管理措施加以保护，以

3、使刺参养殖持续健康发展。2．运用微卫星DNA技术对刺参烟台群体、威海群体、大连群体上海水产大学硕士(博士)学位论文GeneticDiversityandPopulationStructureofApostichopusjaponicusRevealedbyRAPDandSSRMarkersAbstractTwotypesofnuclearmolecularmarkers：randomlyamplifiedpolymorphicDNA(RAPD)andsimplesequencerepeats(SSR)molecularmarkerswereusedtodetectthegenet

4、icdiversityandanalyzethegeneticdivergenceamongfourpopulationsofApostichopusjaponicus,whichwerefromYantai，Penglai，WeilmiandDalian．11他mainresuItswereasfollows：I．9mierosatellitemarkerswereusedtoestimatethelevelofgeneticdiversitybetweenthemturalpopulationandtheculturedpopulationofApostichopusjapo

5、nicus，andcomparedthedegreeofgeneticdifferentiationbetweenthem．ThenumberofallelesgenemtedfTomeachlocusrangedfromfourtotwelveatthenineassessedloci．Themeanvalueofeffectivealleles(ae)inthenaturalpopulationgandculturedpopulationwere6．5556and5．8889；valuesofexpectedheterozygosity(恁)we[eO．7641and0．69

6、41andvaluesoftheaverageobservedheterozygosity(Ho)wereO．6416andO．5635,respectively．TberesultsshowedthatthenaturalresoIⅡ1ccofApostichopusjaponicusinChinawasingoodconditionwimhighergeneticdiversityandtherewasgreatpotentialinpiscatorialgeneticimprovement．Thehetreozygosityandproportionofpolymorphi

7、clociofculturedpopulationwerelowerthanthatofthenatlnmpopulation,whichcouldberelatedtoapossiblepopulationbottleneckassociatedwithbreedingpractice．TheapproachessuchasMarkerAssistedSelection(MAS)shouldbeinducedintotheApostichopusjaponicusculture