鲮微卫星分子标记的筛选及遗传多样性分析

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1、对学校代码：10264研究生学号：M090101088上海海洋大学硕士学位论文题目：鲮微卫星分子标记的筛选及遗传多样性分析Screeningofmicrosatellitemolecular英文题目：markerandgeneticdiversityanalysisformudcarp专业：水产养殖研究方向：水产种质资源与动物遗传育种姓名：刘佳瑶指导教师：郑光明研究员二O一二年五月二十九日上海海洋大学硕士学位论文中国水产科学院珠江水产研究所鲮微卫星分子标记的筛选及遗传多样性分析刘佳瑶指导教师：郑光明（研究员）申请学位：硕士研究方向：水产种

2、质资源与动物遗传育种论文递交日期：2012年4月论文答辩日期：2012年5月学位授予单位和日期：上海海洋大学2012年6月论文评阅人：答辩委员会主席：答辩委员会委员：2012年5月29日ShanghaiOceanUniversityMasterDissertationPearlRiverFisheryResearchInstituteScreeningofmicrosatellitemolecularmarkerandgeneticdiversityanalysisformudcarpbyLiuJia-yaoAdvisor:Prof.Zh

3、engGuang-mingMainfield:FisheryHeredityBreedingMay29,2012上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论

4、文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注李桂峰中山大学教授主席罗建仁珠江水产研究所研究员委员卢迈新珠江水产研究所研究员委员陈昆慈珠江水产研究所研究员委员赵建珠江水产研究所助理研究员秘书中国

5、水产科学研究答辩地点：答辩日期：2012.5.25院珠江水产研究所鲮微卫星分子标记的筛选及遗传多样性分析摘要鲮（Cirrhinusmolitorella）属鲤形目、鲤科、野鲮亚科、鲮属。俗称土鲮、雪鲮、花鲮，主要分布在华南地区，国外见于东南亚。鲮在珠江三角洲流域与草、鲢、鳙合称四大家鱼，因饲源广、抗病力强、群体产量高且能够适应较肥水体，成为华南地区池塘的主养品种。目前由于水体环境污染的日益严重及不规范的养殖操作，不可避免的造成了其遗传多样性的降低，导致其对环境变化承受能力的下降和生长速度减缓等现象的出现。因此，利用分子遗传标记对鲮进行遗传

6、多样性分析并寻求适宜的保护措施，对其种质资源的保护和可持续发展的延续是十分必要的。本文用取自同一批已建立的生长较快西江鲮野生浅色群体的大、小个体组各31尾个体的基因组DNA，分别进行了微卫星分子标记开发与筛选对比实验和鲮遗传多样性分析两部分实验，旨在开发出对鲮适用性强的特异性微卫星DNA分子标记；并通过对其遗传多样性进行分析，开展进一步选育工作，找到对鲮及其他鱼类进行遗传多样性研究、群体遗传结构分析、种群亲缘关系鉴定及种质资源保护等方面的研究方法。以下是实验主要内容：1．鲮微卫星分子标记开发与筛选对比实验通过磁珠富集法得到微卫星引物23对

7、，其中15对可稳定扩增，引物获得的效率为65.22%，多态性引物14对，所占比例为60.87%；通过近缘鱼类引物筛选法筛选微卫星引物33对，其中10对可稳定扩增，引物获得的效率为30.30%，多态性引物8对，所占比例为24.24%，两方法的平均多态信息含量分别为0.5933和0.5692。两者所得引物的多态性均较丰富，但就微卫星引物的获得效率来说，前者是后者的2.15倍，磁珠富集法优于近缘鱼类引物筛选的方法。2．鲮遗传多样性分析本文两种方法共得到能够稳定扩增的微卫星引物25对，其中单态位点引物3对，中度多态位点引物有7对，高度多态位点引物

8、15对，各多态性位点的PIC值从0.2885到0.8457，平均多态信息含量为0.5846。大、小个体组各多态性位点PIC值范围分别为0.2885～0.8050和0.2885～0.8256，其