鲮生长相关微卫星标记筛选及亲子鉴定

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1、学校代码：10264研究生学号：M120101042上海海洋大学硕士学位论文鲮生长相关微卫星标记筛选题目：及亲子鉴定TheScreeningofGrowth-related英文题目：MicrosatelliteandParentageAssignmentinCirrhinusMolitorella专业：水产养殖研究方向：种质资源与遗传育种姓名：王亚坤指导教师：朱新平研究员二O一五年四月二十五日上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个

2、人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海水产大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会

3、成员名单姓名工作单位职称备注桂建芳中国科学院水生生物研究所研究员主席中国水产科学研究院罗建仁研究员委员珠江水产研究所洪一江南昌大学生命科学学院教授委员胡成钰南昌大学生命科学学院教授委员余祥勇广东海洋大学水产学院教授委员中国水产科学研究院史燕副研究员秘书珠江水产研究所上海海洋大学硕士学位论文鲮生长相关微卫星标记筛选及亲子鉴定摘要鲮（Cirrhinusmolitorella）隶属于鲤科(Cyprinidae)，野鲮亚科(Labeoninae)，鲮属(Cirrhinus)，与草鱼、鲢和鳙合称为南方“四大家鱼”，是华南地区重要的养殖鱼类之一。为了解鲮野生群体的遗传结构，以期为人工选育提供更多的选育

4、原材料，对西江肇庆段鲮进行了遗传多样性评估；研究分析了微卫星位点与生长相关性状的关联性，结果找到了7个与生长性状显著或极显著相关的位点，并由此获得了具有生长优势的基因型；建立了多重PCR体系，对鲮进行了亲权鉴定，为良种选育提供了新的技术手段。具体研究内容如下：1．微卫星的开发及遗传多样性研究。基于鲮转录组开发出12对微卫星引物并对64尾鲮进行扩增，研究其遗传多样性。共检测到51个等位基因，群体等位基因数为3-7，平均等位基因数为4.25；观测杂合度为0.375-0.7656，平均为0.6198；期望杂合度为0.3863-0.7714，均值为0.6322；平均多态性信息含量为0.574。有2

5、个位点偏离了哈迪温伯格定律（P<0.05），10个位点显示出了较高的多态性(PIC>0.5)。该体系为鲮的群体遗传多样性分析、渔业可持续发展及相关物种的遗传资源保护提供一定应用价值。2.生长相关微卫星标记筛选及应用分析。运用一般线性模型（Generallinearmodels,GLM）对15个微卫星位点与鲮极大和极小两个群体生长性状的相关性进行最小二乘法分析，结果显示：位点ZJ35108、HLJ6和ZJ33806与体质量、体长和全长均极显著相关；位点MFW1与体质量极显著相关，与体长和全长显著相关；位点ZJ15254和ZJ34676与体质量、体长和全长显著相关；位点ZJ12551只与体质量

6、显著相关，而与体长和全长无相关性。对于相关性显著的位点，利用Duncan法将同一位点的不同基因型与生长性状进行多重比较，初步筛选出了7对生长有价值的微卫星标记和5个具有生长优势的基因型。可用于鲮的遗传改良和良种选育研究。I上海海洋大学硕士学位论文3．微卫星多重PCR体系的建立与亲子鉴定。结合鲮转录组及本实验室前期研究基础，共筛选出13对多态性较高的微卫星引物，并通过调节引物所占比重、循环次数和第一次的延伸时间，构建了可稳定扩增出清晰目的条带的多重PCR系统。在此基础上对鲮2尾雄、5尾雌及其后代146尾仔鱼进行遗传分析及亲子鉴定，结果显示，群体等位基因数范围2＜K＜5，平均3.54；多态性信

7、息含量范围0.271＜P＜0.697，平均0.4953；观测杂合度范围0.183～0.778，平均0.6008；期望杂合度范围0.324～0.741,平均0.5572；无效等位基因频率为1.29％～27.68％；子代模拟和实际亲子鉴定成功率分别为99％和100％。在此基础上，通过将不同母本的子代分别划分为4个不同的群体，运用软件得出群体间的遗传距离并进行聚类分析，为避免近交衰退提供合理路线，该研究为鲮良种选育和种质资源研