兰州鲇微卫星标记筛选及其与生长相关性研究

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1、分类号密级UDC单位代码10733甘肃农业大学硕士学位论文兰州鲇微卫星标记筛选及其与生长相关性研究IsolationofmicrosatellitemolecularmarkersandcorrelationanalysiswithgrowthtraitofSilurusLanzhouensis魏大为指导教师吴旭东研究员（宁夏回族自治区水产研究所银川750001）张利平教授（甘肃农业大学兰州730070）学科专业名称特种经济动物饲养研究方向淡水经济动物生物学及养殖论文答辩日期2015年5月29日学位授予日期2015年6月答辩委员会主席

2、余群力教授评阅人刘哲教授张大治教授2015年5月甘肃农业大学2015届硕士学位论文MasterDissertationIsolationofmicrosatellitemolecularmarkersandcorrelationanalysisgrowthtraitofSilurusLanzhouensisApplicant：WeiDaweiSupervisor：Prof.WuXudongProf.ZhangLipingCollegeofAnimalScience&TechnologyGansuAgriculturalUniversi

3、ty,Lanzhou,P.RChina730070CommencementinJune,2015II甘肃农业大学2015届硕士学位论文项目资助本论文研究得到国家自然科学基金项目“兰州鲇生长发育性状分子遗传学基础研究（No.31360633）”、宁夏对外科技合作项目“基于分子标记黄河鲶良种家系选育技术研究”资助，在宁夏回族自治区水产研究所分子遗传学试验室完成ThisstudywasfinanciallysupportedbytheNationalNaturalScienceFoundationofChinaandtheExternalC

4、ooperationProjectsofNingxia,whichresearchonthegeneticbasisofgrowthtraitsforLanzhoucatfish(Siluruslanzhouensis)(ProjectNo.31360633)andstudyonthebreedingfamilyofLanzhoucatfishbasedonmolecularmarkerstechniques,respectively.ThisstudywascarriedoutattheMolecularGeneticsLabofN

5、ingxiaFisheriesResearchInstitute.III甘肃农业大学2015届硕士学位论文摘要兰州鲇（Siluruslanzhouensis）又名黄河鲇，是黄河上游特有的大型经济鱼类。营养价值高，具有十分广阔的养殖前景。近些年来，由于水体污染、过度捕捞、综合水利工程建设等因素，兰州鲇野生种群数量急剧下降，已成为深受各界关注的濒危物种。因此，寻求有效的遗传标记对兰州鲇种质资源保护利用、遗传图谱构建、经济性状的QTL定位以及分子标记辅助育种是十分必要的。本次实验分别进行了兰州鲇多态性微卫星标记筛选及与其生长相关性分析两部分

6、，以下是实验主要内容：1．应用FIASCO（FastIsolationbyAFLPofSequencesComainingRepeats）方法构建了兰州鲇(AC)n、(AG)n、(ATC)n、(CAG)n、(AAAC)n、(AGAT)n和(GATA)n核心序列G-SSR（基因组微卫星）富集文库。结果获得326条G-SSR，（GenBank登陆号：KJ008462-KJ008582，KJ545973-KJ545998，KJ598088-KJ598120，KP280324-KP280469）阳性序列率为40.75％。其中，完美型微卫星17

7、0条，占52.15%；非完美型微卫星72条，占22.09%；复合型84条，占25.76%；重复次数主要分布在10~20次，重复次数在30次以下的比例为80.16%。结果表明，经优化的磁珠富集法可以更高效的构建兰州鲇G-SSR文库。2．基于公共数据库GenBank，以现有鲇形目中与兰州鲇亲缘关系较近的革胡子鲇科和鲇科ESTs（ExpressedSequenceTag）共2002条序列，筛选兰州鲇E-SSR（表达标签序列微卫星）分子标记。结果共发现209个微卫星序列，占ESTs数据库的10.44%；其中三碱基重复为主导型，共76个（36.

8、36%），其次是二碱基重复序列59个（28.22%）、四碱基重复序列52个（24.88%）、五碱基重复序列17个（8.13%）、六碱基重复序列5个（2.41%）；而双碱基重复中TG/CA形式最为主，三碱基重复中AAT/A