象草遗传多样性的rapd分析

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1、广西大学硕士学位论文象草遗传多样性的RAPD分析姓名：蓝亦锋申请学位级别：硕士专业：动物营养与饲料科学指导教师：赖志强20120628象草遗传多样性的RAPI)分析摘要以广西南宁地区的9种象草的幼嫩叶片为材料，研究了RAPD—PCR反应条件；并应用RAPD分子标记对9份象草的遗传多态性、亲缘关系等进行分析，结果表明：1．RAPD—PCR优化的最终体系为：总体积为20此，反应体系中含有总体积20皿，反应体系中试剂添加量：10xPCRBuffer2．01xl_,、帅s(各10mM)0．4此、primer(10pM)1．2止、M92十(2

2、5mM)1．5止、TaqE(SWIJLL)0．4皿、DNA(10ng)2．O止、ddH20upto20止。2．筛选出12条RAPD引物进行RAPD分析。12条RAPD引物共检测到51个位点，其中多态位点占100％，Nei’s基因多样度为0．3108，Shannon信息指数为0．4781；砒姬D标记显示象草具有丰富的遗传多态性。3．基于RAPD扩增构建相应的Nei’s遗传距离矩阵，以及UPGMA树图。4．根据电泳结果记录清晰可重复的RAPD条带。当用同一引物对9种象草DNA进行电泳时，同一迁移率的条带记为一个位点，扩增带存在时记为1，

3、否则记为O，用NTSYS软件进行运算并作图。通过聚类分析得出，9种象草可明显分为两大类。由于这9种象草可明显分为亲缘关系较远的两大类，进行象草杂交育种时可以尝试分别采用两大类象草中的一种作为亲本材料，杂交得出的后代可能会有比较优异的生产性状和表型性状，从而为象草的杂交育种提供科学依据和理论依据。关键词：象草随机扩增多态性DNA简单序列重复标记条件优化遗传多样性STUDYoNGENETICDIVERSITYOF尸E7V=；啦丁U^夕SSP．BYRAPDMARKERABSTRACT9Pennisetumssp．materialsfrom

4、GuangxiNanningwerestudiedforoptimizingtheRAPDreactionconditionsandprocedure．Penffisetum’SgeneticdiversityandrelationshipwerestudiedbyRAPDmarkers．Themajorresultsshowed嬲follows：1．TheobtainedoptimumschemewasfoundonreactionsystemforRAPD—PCR：10xPCRBuffer2．0I-tL、dNTPs(eachlO

5、mM)O．4肛L、primer(10pM)1．2止。、M92+(25mM)1．5此、TaqE(5U／此)0．4此、DNA(10ng)2．0此、ddH20upto20}此．2．TheanalysisofRAPDmarkershowedthat12RAPDprimersamplifiedatotalof51seorablemarkers，percentageofpolymorphiclociWas100％，Nei’sgeneticdiversityandshannon’Sinformationindexwere0．3108and0．47

6、81．TheresultsofRAPDsilowedthatthegeneticdiversityofforageresourcesonpennisetumWasrich．3．ThematrixesofgeneticdistanceandUPGMAclusterwereestablishedonRAPDfingerprint．4．TheclearandreproducibleRAPDbandswererecordedaccordingtotheelectrophoresisresults．Intheamplificationprod

7、uctsbythesameprimer,bandswiththesamemobilitywererecordedtoalocus,"l’'Wasrecordedwhenthebandexisted．Otherwise,"0’'WaSrecorded．NTSYSsoftwareWasusedforcalculationandmappingaccordingtothedata．Byclusteringanalysis，9kindsofPennisetumssp．canbeclearlydividedinto2categories．Bec

8、ausethese9kindsofPennisetumssp．canbeclearlydividedintotwodistantcategories，wecantrytousetwoPennisetumssp．fromdifferen