青岛百合复合种群遗传多样性的rapd分析

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1、青岛百合复合种群遗传多样性的RAPD分析  :对青岛百合(LiliumtsingtauenseGilg)复合种群6个局部种群的遗传多样性进行了RAPD分析。通过11个引物扩增到117个显性位点,其中多态性位点平均为62.86%,各百合群体多态性位点多少顺序为Y5、Y1、Y4、Y6、Y2、Y3。把RAPD多样性指标与样地的基本状况进行相关分析,发现海拔高度、样地坡度和植被类型与各个多样性指标呈正相关,样地坡向与各个多样性指标呈负相关。Neis基因多样度指数(h)和Shannon信息指数(I)的统计结果表明,种群内h和I的平均值分别为0.2034和0.3090,这两个指数均为Y5最高,其次为Y1,

2、Y3最低。不同位点在种群间的分化程度差别很大,基因分化度的波动范围为0.0165~0.9427,平均为0.3783。种群间平均基因流为0.8216,说明有遗传漂变的存在。6个百合种群间遗传一致度与遗传距离的无偏估计表明,最小的遗传距离在Y4和Y6之间,最大的遗传距离在Y3和Y5之间,遗传一致度则相反。种群聚类分析表明,Y1和Y2比较近;Y4和Y6比较近又和Y5联系在一起。Y3比较特殊,单独为一类。  关键词:青岛百合(LiliumtsingtauenseGilg);复合种群;遗传多样性;RAPD;遗传漂变;遗传距离  :S682.2;:A:0439-8114(2014)13-3074-04  

3、RAPDAnalysisofGeicDiversityoftheLiliumtsingtauenseMetapopulation  ZHANGCong-min1,ZHANGZhi-guo2  (1.SchoolofBiologicalScienceandBiotechnology,MinnanNormalUniversity,Zhangzhou363000,Fujian,China;  2.SchoolofLifeSciences,ShandongUniversity,Jinan250100,China)  Abstract:GeicdiversityofsixLiliumtsingtauen

4、semetapopulationsethodofRAPD.ThegeicdifferentiationamongpopulationsplifiedbyRAPD.Themeansofgeicdiversityationshoeanongpopulations0.0165to0.9427,eanof0.3783.Thechangeofgenefloeansofgenefloongpopulations.FromNeisunbiasedmeasuresofgeicidentityandgeicdistancebyRAPD,it.  Keytsingtauense;metapupulations;g

5、eicdiversity;RAPD;geicdrift;geicdistance  青岛百合(LiliumtsingtauenseGilg)是我国百合科的特有种,已列入第二批国家保护植物名录[1]。由于栖息地干扰的加剧,青岛百合的分布范围日趋缩小,目前,青岛百合的集中分布地位于崂山北九水以南海拔400~1000m的森林群落内,这一区域可见到成片分布的种群,均呈斑块状分布,斑块之间的距离依地形、地貌及人类活动的强度不同而远近不一,以复合种群存在[2]。  目前对百合的研究在国内已有不少报道,主要集中在其地理分布、化学成分、组织培养、细胞学观察及杂交育种等方面,但鲜见关于青岛百合的研究。一个物种的

6、稳定存在与其群体的遗传多样性水平和遗传结构密切相关[3],因此对青岛百合遗传结构的研究将有助于探讨其濒危原因及过程,采取科学有效的措施进行保护,并且能为其分类、进化研究提供资料,进而为育种和遗传改良提供遗传学依据。RAPD技术是一种简便、快速、易行的分子标记技术,试验用RAPD技术分析了青岛崂山6个样地(Y1~Y6)的青岛百合复合种群的遗传多样性、群体内和群体间的遗传变异,旨在为青岛百合遗传结构的研究提供依据。  1材料与方法  1.1材料  试验从6个样地(Y1~Y6)各随机取20株青岛百合的幼嫩顶芽,迅速置于冰盒中带回实验室于4℃保存,7d内进行总DNA的提取。  1.2方法  1.2.1

7、基因组DNA的提取6个样地共120份样品,采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法[4]稍作修改后提取基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳,LALBgCl2等。反应程序为:94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸2min,40个循环;最后72℃延伸7min。扩增反应在德国BIOMETRA-GRANDIENTPCR仪上进行。  1.3RAPD数据的统计  1.3.1多态性位点比例(P)P=多态性

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