阵列芯片在人乳头瘤病毒基因分型检测中的应用评估.pdf

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1、分子诊断与治疗杂志2009年11月第1卷第4期JMolDiagnTher,November2009,Vol.1No.4·227··论著·寡核苷酸微阵列芯片在人乳头瘤病毒基因分型检测中的应用评估汪圣强1★杭莉虹1钱盼盼1高杰1胡守旺2[摘要]目的探讨寡核苷酸微阵列芯片技术在人乳头瘤病毒(HPV)检测中的实用价值。方法使用HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒对227例宫颈拭子样本进行16种高危型(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304)和5种低危型(6,11,42,43和44)检测,所检测的样本为HC2探针捕捉法检

2、测所得到的HPV高危型和低危型样本,用以评估该DNA微阵列试剂的性能。结果190例经HC2法检测为高危型HPV阳性以及30例被HC2法检测为低危型的样品被寡核苷酸微阵列芯片试剂盒检测出具体的高危和低危HPV型别,总共检测出13种高危型和5种低位危型HPV亚型,在高危亚型中,各型检出率分别是16型26.01%、58型20.18%、52型14.71%、68型7.59%、31型7.13%、33型6.37%、66型6.24%、18型4.05%、59型2.18%、39型1.10%、56型1.50%、45型1.40%、51型1.07%;在低危亚型中,各型检出率分别为6型45.43%、11

3、型29.70%、42型14.11%、43型5.89%和44型5.00%。单一HPV亚型感染及2种、3种HPV亚型混合感染分别为60.46%、29.89%、9.65%。7例经HC2检测为高危型,但寡核苷酸微阵列芯片试剂盒未能检测出HPV的具体型别,寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测结果的符合率为96.92%(220/227)。结论HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测阳性符合率高,并可以明确具体分析21种HPV型别,是一种准确、高效、经济的HPV型别检测方法,可用于HPV的常规基因型分型诊断及人群筛查。[关键词]HPV;基因分型;寡核苷酸微阵列

4、芯片试剂盒ApplicationevaluationofoligonucleotidemicroarrayforhumanpapillomavirusgenotypingWANGShengqiang1★,HANGLihong1,QIANPanpan1,GAOJie1,HUShouwang2(1.WuxiEntry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Jiangsu,Wuxi214101,China;2.DaAnGeneDiagnosticCenterofYat-senUniversity,Guangdong,Guangzhou510665,Ch

5、ina)[ABSTRACT]ObjectiveToexploretheapplicationvalueofoligonucleotidemicoarrayforhumanpapillomavirus(HPV)detection.Methods227samplesofdacronswabsaretestedbyOligonucleotideMicoarraykitforHPVgenotypingof16highrisksubtypes(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304),and5lowrisksubt

6、ypes(HPV6,11,42,43,44),thesampleswereHC2kittestedforhighriskandlowrisksubtypes,beintendedforperformanceevaluationoftheOligonucleotideMicoarraykit.Results190highriskand30lowriskHPVsubtypepositivecasesweregenotypedsepciifcallybyOligonucleotideMicoarraykitviablindassay.13highriskHPVgenotypeswe

7、redetected,namelyHPV16(26.01%),58(20.18%),52(14.71%),68(7.59%),31(7.13%),33(6.37%),66(6.24%),18(4.05%),59(2.18%),39(1.10%),56(1.50%),45(1.40%),51(1.07%),and5lowriskHPVgenotypesweredetectedas6(45.43%),11(29.70%),42(14.11%),43(5.89%)and44(5.00%).Thedetecti

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