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时间:2019-07-31
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1、目录SPM简介和安装................................................................................................................................1一、数据准备(先设置数据输入和输出目录,再转换数据格式)............................................2二、数据预处理流程..................................
2、.......................................................................................20、预处理的workflow......................................................................................................................21、SliceTiming时间层校正................
3、.............................................................................................22、Realignment头动校正................................................................................................................33、Coregister配准.................
4、...........................................................................................................54、Segment分割...............................................................................................................................65、Normal
5、ize空间标准化................................................................................................................66、Smooth平滑............................................................................................................................
6、....8三、GLM模型和Specify1st-level...................................................................................................9四、实例:任务态数据预处理和一阶分析的批处理..................................................................13SPM简介和安装SPM,即统计参数图,也是这个软件的最终输出,它是由英国
7、伦敦大学的Friston教授等人在通用数学软件包Matlab基础上开发的软件系统,其统计功能非常强大,设计这个软件包的初衷是采用统计的方法来处理fMRI,PET和SPECT的数据。用SPM进行数据处理分析过程主要分为两大部分:预处理过程和统计分析过程。需要注意的是,静息态、任务态和DTI数据的预处理大致框架一致,但具体步骤不同,本教程主要讲任务态数据处理。数据预处理主要包括三个大框架:(1)Convertdicomfilestohdrfilesandimgimages;(2)Temporalprocess
8、ing,即SliceTiming;(3)Spatialprocessing,包括Realign、Normalize和Smooth。具体步骤下面有讲。统计分析过程包括:个体分析和组分析。使用Specify1stlevel做单个被试(singlesubject)分析;使用Specify2ndlevel做组分析(groupanalysis)。先写一下SPM8的安装:有必要说一下SPM实际不是一个独立的软件,它相当于一个用Matlab
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