spm8-fMRI数据处理

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1、目录SPM简介和安装................................................................................................................................1一、数据准备（先设置数据输入和输出目录，再转换数据格式）............................................2二、数据预处理流程..................................

2、.......................................................................................20、预处理的workflow......................................................................................................................21、SliceTiming时间层校正................

3、.............................................................................................22、Realignment头动校正................................................................................................................33、Coregister配准.................

4、...........................................................................................................54、Segment分割...............................................................................................................................65、Normal

5、ize空间标准化................................................................................................................66、Smooth平滑............................................................................................................................

6、....8三、GLM模型和Specify1st-level...................................................................................................9四、实例：任务态数据预处理和一阶分析的批处理..................................................................13SPM简介和安装SPM，即统计参数图，也是这个软件的最终输出，它是由英国

7、伦敦大学的Friston教授等人在通用数学软件包Matlab基础上开发的软件系统，其统计功能非常强大，设计这个软件包的初衷是采用统计的方法来处理fMRI，PET和SPECT的数据。用SPM进行数据处理分析过程主要分为两大部分：预处理过程和统计分析过程。需要注意的是，静息态、任务态和DTI数据的预处理大致框架一致，但具体步骤不同，本教程主要讲任务态数据处理。数据预处理主要包括三个大框架：（1）Convertdicomfilestohdrfilesandimgimages；（2）Temporalprocess

8、ing，即SliceTiming；（3）Spatialprocessing，包括Realign、Normalize和Smooth。具体步骤下面有讲。统计分析过程包括：个体分析和组分析。使用Specify1stlevel做单个被试(singlesubject)分析；使用Specify2ndlevel做组分析(groupanalysis)。先写一下SPM8的安装：有必要说一下SPM实际不是一个独立的软件，它相当于一个用Matlab