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1、河南农业科学,2011,40(7):147151JournalofHenanAgriculturalSciences147鲤鱼Sox9基因HMG保守区的克隆及序列分析1*122华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳(1.中州大学化工食品学院,河南郑州450044;2.河南师范大学生命科学学院河南新乡453007)摘要:为研究鲤鱼中与性别决定及骨组织发育相关基因Sox9的特征及功能,从大量常见养殖鲤鱼品种及黄河野生鲤鱼个体中克隆得到了多个版本CcSox9基因的HMG保守区序列,并对这些序列及国内外的其他鲤鱼Sox基因进行了启动子、多态性等序列分析。结果显示,
2、鲤鱼中至少存在5个版本的活性Sox9基因及1个Sox9假基因。这些基因在编码序列中存在一定的多态性,在内含子序列中存在大量序列多态,并且活性基因中都存在至少1个启动子序列。假基因无内含子序列,在编码序列中存在多个终止密码子。关键词:Sox9基因;鲤鱼;克隆;序列分析中图分类号:S965116文献标识码:A文章编号:10043268(2011)07014705CloningandSequenceAnalyzingofSox9GenesHMGSectionofC.carpio1*122HUAHuiying,WANGFang,CHANGZh
3、ongjie,DUQiyan(1.ChemicalEngineeringandFoodDepartment,ZhongzhouUniversity,Zhengzhou450044,China;2.BiologicalScienceCollege,HenanNormalUniversity,Xinxiang453007,China)Abstract:ToinvestigatethefeaturesandfunctionsofSox9geneswhicharerelatedtosexdeterminationandbonytissuedevelo
4、pmentinC.carpio,severalCcSox9geneswereclonedfromlargequantityofindividualsofseveralusualC.carpiovarietiesandwildYellowRiverC.carpio.Sequences,includingpromotersequences,polymorphism,oftheseCcSox9genesandotherCcSox9genesclonedbyotherdomesticandforeignareaswereanalyzed.Theresults
5、revealedthatatleast5activeCcSox9genesandapseudogenePCcSox9werefound.Abundantpolymorphisms,includingsequencepolymorphismsandlengthpolymorphisms,werefoundinthesegenescodingsequences,especiallyintrons.AtleastonepromotersequencecanbefoundineachactiveCcSox9genesintron.PseudogenePC
6、cSox9hasnointronandseveralterminalcodonswerefoundinitscodingsequence.Keywords:Sox9gene;C.carpio;Clone;SequenceanalysisSox(SRYrelatedHMGbox)基因是在动物中发现出一定的原始特征(如存在性别反转、雌雄同体等[13][12]现的一个编码转录因子的庞大基因家族,在动物现象),但又有了相当程度的发展。在鱼类中应该[46]胚胎发育及多种生化过程中扮演着重要角色。存在一些性别决定及分化、软骨组织发育遗传体系的Sox9基因
7、在哺乳动物中与性别决定、骨组织发育密成员及运行机制的原始形式,因此,对鱼类中Sox9[1314]切相关,有关Sox9基因的研究是近年来的研究热点基因的研究具有非常重要的意义。[711]之一。鱼类的进化地位非常特殊,处于从无脊椎鱼类是最原始的脊椎动物,研究其骨骼发生发动物向脊椎动物进化的关键节点,其性别决定体系表育及相关基因对于研究脊椎动物起源、骨组织进化收稿日期:20110202作者简介:华慧颖(1972),女,河南郑州人,讲师,硕士,主要从事生物能源及动物遗传学研究。*为通讯作者。Email:vinnie_h@163.com148河南农业科
8、学第40卷及相关因素具有重要意义。鲤鱼是最重要的经济鱼针对CcSox9a:引物
