葡萄MADS-box家族基因保守片段的克隆与序列分析

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1、维普资讯http://www.cqvip.com果树学报2007,25(1):27~32JournalofFruitScience葡萄MADS—box家族基因保守片段的克隆与序列分析宗成文,-,房经贵,陶建敏,章镇,钱亚明(南京农业大学园艺学院,南京210095;延边大学农学院,龙井133400;江苏省农业科学院园艺研究所,南京210014)摘要:MADS—box转录因子在多种植物的发育过程特别是花器官和果实发育过程中发挥重要的作用。为了从葡萄中克隆出新的MADS—box基因,研究在葡萄花及果实发育中的作用,根据多种植物

2、MADS—box基因保守区序列,设计简并引物,应用RT-PCR技术从红富士葡萄花序中分离出34条MADS—box基因cDNA片段。序列分析表明,这些片段长度在138~152bp之间,包含基因起始密码子。推导的氨基酸序列与已登录的欧洲葡萄及其它物种的MADS~box基因同源性超过83%。用推导的氨基酸序列与已知的欧洲葡萄和拟南芥MADS—box家族基因进行系统发育分析,可将这些基因片段分别归入拟南芥MADS—box基因不同亚家族中,证明葡萄中存在多种MADS—box家族基因,克隆的片段包含ABCDE模型中的各类花发育基因。

3、关键词:葡萄:MADS—boxgene;RT-PCR;序列分析中图分类号:$663.1文献标识码:A文章编号:1009—9980(2008)01—27一O6CloningandsequenceanalysisofMADS-boxfamilyproteingenefrag-mentsfromgrapefVitisvinifera×labrusca)ZONGCheng-wen1,2FANGJing-gui,TAOJian-min,ZHANGZhen,QIANYa-ming(CollegeofHorticulture,Nanj

4、ingAgriculturolUniversity,Nanjing,Jiangsu210095China;。CollegeofAgricuhure,YanbianUniversity,Longing,Jilin133400China;3InstituteofHorticulture,jiangsuAcademyofAgriculturolSciences,Nanjing,Jiangsu210014China)Abstract:Asakindoftranscriptionfactors,MADS—boxgenesplaya

5、nimportantroleinvariousplantdevelopmentprocess—es,especiallyinthedevelopmentoffloralorgansandfruit.InordertoisolatenewMADS—boxgenesandfindoutthefunctionofthesegenesinthedevelopmentofgrapefloralorgansandfruit,wedesignedtodegenerateprimersaccordingtotheconser—vativ

6、eregionsequencesofvariousplantsMADS—boxfamilygene.obtained34MADS—boxgenefragmentsbyRT—PCRfromgrapeinflorescenceeDNA.Sequenceanalysisindicatedthelengthofthesefragmentswasbetween138—152bpincludingtheinitiationcodonofgenes.deducedaminoacidsequenceshadahigheridentity

7、ofover83%withMADS—boxgenesofgrapevineandotherspecies.SequencesanalysisbyphylogenyconstructioncouldgetallthesegenefragmentsdividedintotheArabidopsi~MADS—boxgenesubfamily.TheseresultsindicatedthatthereweremanyMADS—boxgenesingrape.Thesegenefragmentscoveralltypesoffl

8、oraldevelopmentgenesofABCDEmode1.Keywords:Grape;MADS—boxgene;RT-PCR;SequenceanalysisMADS—box是一个保守性很强的DNA结合结作用【3卅。通过对该调控蛋白的深入研究,科学家提出构域。最早在酵母niChromosomeMainten

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