栽培黑麦waxy基因的克隆及序列分析翻译文献

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1、学号:2009010029还北农林哥妆大学2013届本科生毕业论文(设计)题目:栽培黑麦胎xp基因的克隆及序列分析学院(系):农学院专业年级:农学09级学生姓名:夏元燕指导教师:陈其皎合作指导教师:完成日期:二O—三年六月1文献综述11.1栽培黑麦的应用价值11・2黑麦基因资源在小麦育种中的研究现状及应用前景21.3籽粒淀粉合成与Waxy蛋白的关系研究31.4Waxy蛋白研究状况错误!未定义书签。1.5必兀y基因的研究状况71.6木实验的研究意义82栽培黑麦胎Q基因的克隆102.1材料少方法102.1.1试验材料102.1.2试剂102.1.3仪器102.2试验方法112.

2、2.1引物设计与合成112.2.2黑麦基I天1组DNA的提取(微量CTAB法)112.2.3目的基因的扩增122.2.4冃的片段的回收纯化122.2.5冃的片段的连接与质粒转化132.2.6筛选阳性克隆132.2.7核酸及蛋白序列分析143结果与分析153」目的基因的扩增153.2VW基因核酸序列分析153.3Waxy蛋白序列及结构分析163.4Waxy蛋白系统演化树的构建174总结与讨论194.1实验总结194.2讨论19参考文献20附录22致谢35栽培黑麦胎矽基因的克隆及序列分析作者:夏元燕指导教师:陈其皎扌商要:淀粉是自然界含量绘为丰富的碳水化合物z—,也是禾谷类作物

3、(小麦、大麦、玉米、水稻等)籽粒的主要能量储存物质。作为禾谷类作物籽粒和而粉的主要成分,组成淀粉的直链淀粉和支链淀粉的含量和其比例是影响而粉口味和加工品质的主耍因素z—。在控制植物直链淀粉合成中,颗粒结合型淀粉合成^(Granuleboundstarchsynthase,GBSS)起着至关重要的作用,该酶也叫Waxy蛋白,由"勾级基因编码,与淀粉粒特异性结合后,指导直链淀粉的合成。肖植物体内缺乏Waxy蛋白时,直链淀粉的合成就会受到阻碍,进而影响小麦籽粒中直链淀粉的最终含量。栽培黑麦JSocalccerealeL.)是除小麦之外唯一适合做而包的谷类作物,作为栽培小麦的近亲,

4、对黑麦的研究历来受到重视。本研究利用微量CTAB法提取了5份栽培黑麦品种的基因组DNA,利用特杲性引物进行PCR扩增,均得到了大小约2800bp的目的条带。NCB1在线BLAST表明,所得序列与黑麦品种Rogo的胎砂基因的编码序列貝有95%的相似隊序列比对表明黑麦炬u基因山11个外显子和10个内含子组成,去除内含子后,编码区长度为1815bp,编码604个氨基酸残基,序列比对表明编码区的同源性高达99%。将殆xy基因的编码区翻译成氨基酸后进行Motifscan在线预测,结果显示,醃xy蛋白的催化区由第78-339位共262个氨基酸残基组成,非催化区则分布在第379-516位

5、氨基酸残基。余下的第71-77位和517-604位氨基酸残基分别纟fl成了Waxy蛋白的C-端非催化区和N-端非催化区。演化树的聚类分析表明,5条来源于黑麦的Waxy蛋白在氨基酸水平上与栽培人麦、野主二粒小麦和硬粒小麦遗传关系较为接近,与普通小麦、山羊草和大麦的遗传关系较远。关键词:黑麦;殆xy基因;克隆;序列分析CLONINGANDSEQUENCEANALYSISOFWaxyGENESFROMCOMMONRYESABSTRACT:Starchisoneofthemostabundantcarbohydratesinplant,itisalsothemainstoragem

6、aterialincerealcropsuchaswheat,rice,maize,barley,ryeandsoon.Asthemaincomponentinthegrainsandflourofcerealcrops,thecompositionofstarch,namelythecontentofamylaseandamylopectin,isthemajorfactorthatdeterminestheprocessingqualityandflavorofflou匚Inthecontrollingofamylosebiosynthesis,granule-boun

7、dstarchsynthaseplaysakeyrole.ThisenzymeisalsocalledWaxyprotein,encodedbyWaxygene・Afterspecificallybindswithstarchgranules,Waxyproteincankeepamyloseunbranched・SoamylosesynthesiswouldbehamperedwhenthereisalackofWaxyproteininplantorgan.Andthen,thefinalcontentofam

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