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《柑橘类病毒CVd-Ⅲ的检测及鉴定》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、植物病理学报ACTAPHYTOPATHOLOGICASINICA39(2):207-211(2009)柑橘类病毒CVd一Ⅲ的检测及鉴定马先锋,李芳,-,胡春华。,韩健,戴素明,曾柏全,邓子牛(湖南农业大学园艺园林学院,长沙410128;。国家柑橘改良中心长沙分中心,长沙410128;。广东农业科学院果树研究所,广州510640;湖南农业科学院园艺研究所,长沙410125;中南林业科技大学生命科学院,长沙410004)Detectionandldentificationofcitrusviroid一111MAXian.feng,LIFang,HUChun-hua3,HA
2、NJian,DAISu.ming’,ZENGBai-quan,DENGZi—niu’(HorticultureandLandscapeCollege,HunanAg—riculturalUniversity,Changsha410128,China;。NationalCenterforCitrusImprovement—Changsha,Changsha410128,China;。InstituteofFruitTreeResearch,GuangdongAcademyofAgriculturalScience,Guangzhou510640,China;Instit
3、uteofHorti-cultureHunanAcademyofAgriculturalScience,Changsha410125,China;CoUegeofLifeScience,CentralSouthForestryUniversity,Changsha410004,China)Abstract:TotalRNAwasisolatedfromphloemofyoungshootsandretro-transcfiptedtocDNAbyRT-PCR(ReverseTranscriptasePolymeraseChainReaction)withspecifi
4、cprimerpairofCVd—HI(citrusviroid—HI),theresultsofmoleculardetectionindicatedthattheCVd一111specificbands,about300bp,weredetectedin27ofthe49samplescollectedfromdiferentcountiesinHunanProvinceandlsamplepresentedbyCataniaUni-versity.AlltheamplifiedcDNAfragmentswereclonedandsequences,sequenc
5、eanalysiscomparedwiththereportedCVd·111sequencesinGenBankshowedthat:sequencesof21sampleswerethesameandcompletelyidenticalwithCVd-llIb(AF184147);however,thesequencesoftheother6samplesandpresentedsamplewerediversifiedfromtl1ereportedCVd一11IsequencesinGenBank.Keywords:citrus;viroid;CVd—I!I
6、;RT—PCR;sequenceanalysis文章编号:0412-0914(2009)02-0207-05类病毒是迄今为止已知的能引起植物病害的橘类病毒CVd—IV(CitrusviriodIV)和柑橘类病毒最小致病因子,为单链环状RNA,大小为246~475CVd—os(Citrusviriodos)。有的类病毒又可分为nt,不编码任何蛋白,但是,类病毒利用其特殊的结多个亚型,如柑橘类病毒CVd.111分为多个序列亚构能在寄主编码蛋白内自行复制H。1998年,型:CVd.IIIa、CVd一11Ib、CVd.11Ib(Australia)、CVd—Flores等报道
7、了20多种不同的类病毒类型,其nlC和CVd.11Id,它们的区别主要是中央保守区和中柑橘类病毒可分为6大类:柑橘裂皮病类病毒可变区的序列碱基差异,这些差异对指示植物矮化CEVd(Citrusexocortisviriod),柑橘类病毒CVd—I及引起病害症状的影响尚不清楚。多数类病毒会(CitrusviriodI,又名Citrusbentleafviroid),柑引起寄主植物病害,但有些类病毒,如CVd.III部分橘类病毒CVd.Ⅱ(Citrusviriod1I,又名Hopstunt亚型虽减少树势生长但不引起特殊的病害症viroid),柑橘类病毒C
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