CR技术分离目的基因

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1、第二节PCR技术分离目的基因一PCR技术1PCR的含义PCR（polymerasechainreaction）：模仿细胞内发生的DNA复制过程，体外大量合成目的DNA片段，包括变性、退火、延伸三个步骤。2PCR反应程序：（1）90－95℃模板变性（2）37－60℃引物与模板复性（退火）（3）70－75℃引物延伸，合成模板链DNA的互补链循环25-35次加热变性复性复温DNA的变性和复性加热或强酸、碱性作用可以使DNA双螺旋的氢键断裂,双链解离,形成单链DNA,这称为DNA的变性。解除变性的条件后,变性的单链可以重新结合起来,形成双链,

2、其原有的特性和活性可以恢复,这称DNA复性,也叫退火。KaryB.Mullis（1944－）http://www.karymullis.com引物引物Mullis’ideaDNA聚合酶DNA聚合酶特定DNA片段1983年TaqDNA聚合酶（thermusaquaticus)酶活性(%)温度(℃)405060708090100100806040201988年Saiki等将耐热DNA聚合酶（Taq）引入了PCR技术3PCR反应体系的组成1）DNA模板2）引物引物是指与待扩增的靶DNA两端序列互补的人工合成的寡聚核苷酸（15－30bp）。3

3、）dNTPs4）耐热性DNA聚合酶5）反应缓冲液PCR引物的设计原则:1.引物的特异性引物与非特异扩增序列的同源性不要超过70%或有连续8个互补碱基同源。2.长度寡核苷酸引物长度为15~30bp。3.G+C含量G+C含量一般为40%~60%。其Tm值是寡核苷酸的解链温度，即在一定盐浓度条件下，50%寡核苷酸双链解链的温度。Tm值最好接近72℃以使复性条件最佳。4.碱基础随机分布引物中四种碱基的分布最好是随机的，不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不应超过3个连续的G或C，因这样会使引物在G+C富集序列区错误引发。5.引物自身引物自身

4、不应存在互补序列，否则引物自身会折叠成发夹状结构牙引物本身复性。这种二级结构会因空间位阻而影响引物与模板的复性结合。若用人工判断，引物自身连续互补碱基不能大于3bp。6.引物之间 两引物之间不应不互补性，尤应避免3′端的互补重叠以防引物二聚体的形成。一对引物间不应多于4个连续碱基的同源性或互补性。逆转录PCR(RT-PCR)将mRNA逆转录与PCR技术相偶联的一种基因分离技术。二PCR技术分离目的基因ＲＴ－ＰＣＲ逆转录酶ＤＮＡ聚合酶mRNAcDNA杂化双链PCR扩增RACE（RapidamplificationofcDNAends

5、）cDNA末端的快速扩增技术，是以mRNA为模板合成cDNA第一条链后用PCR技术扩增出某个特异位点到3’或5’端之间未知序列的方法。3’-RACE5’-RACE思考题：1什么是PCR？PCR包括哪三个基本步骤，各步骤的反应温度有什么特点？2PCR反应体系有哪些重要组成成分？什么是引物？引物有哪两种类型？3什么是RACE？它包括了哪两种PCR反应？目的基因的分离技术：基因文库技术PCR技术插入突变法分离目的基因图位克隆法分离目的基因（chromosomewalking）酵母双杂交技术分离目的基因基因芯片技术蛋白质组学技术....第三节

6、基因的化学合成在基因的化学合成中，首先要合成出有一定长度的、具有特定序列结构的寡核苷酸片段，然后再通过DNA连接酶的作用，使它们按照一定的顺序共价地连接起来。目前已发展出来的有关寡核苷酸片段的化学合成方法有磷酸二酯法、磷酸三酯法、亚磷酸三酯法，以及在后二者基础上发展起来的固相合成法和自动化法。磷酸二酯法（最早创立的DNA化学合成方法）基本原理：将两个在5’或3’—末端各带有适当保护基团的脱氧单核苷酸连接起来，形成一个两端都被保护的二核苷酸分子。然后此分子脱保护（除去一端的保护基团），再进行新的缩合反应。Sanger双脱氧链终止法利用D

7、NA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸顺序的方法，是由英国剑桥分子生物学实验室的生物化学家F.Sanger等人于1977年发明的。它的基本原理是，利用了DNA聚合酶所具有的两种酶催反应的特性：第一，DNA聚合酶能够利用单链的DNA作模板，合成出准确的DNA互补链；第二，DNA聚合酶能够利用2’，3’—双脱氧核苷三磷酸作底物，使之参入到寡核苷酸链的3’—末端，从而终止DNA链的生长。第四节DNA测序思考题:Sanger双脱氧链终止测序法的基本原理是什么？此方法中用到的一种重要底物是什么？