3-苯氧基苯甲酸微生物分解代谢的调控机理研究

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1、分类号0939?学号爲音泉毒义參学术型博击学位论文3-苯氧基苯甲酸微生物分解代谢的调控机理研究成明根指导教师何健教授学科口类聖_^专业名称微生物学研究方向环境微生物学与环境微生物工程答辩日期二〇—五年十二月STUDYONTHETRANSCRIPTION乂LREGULATIONOF-PHENOXYBENZOATEMICROBIAL3CATABOLISMByChenMinengggSuervisedbpyProf.He

2、JianADissertationSubmittedtoNaninAriculturalUniversitjggyInPartialFulfiHmentof化eRequirementsForl:heD巧reeofPh.DComletedinOctob巧2015pCommencementinDecember2015,原创性声明:本人郑重声明所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研巧工作所取得的成果。除文中己经注明引用的内容外,本论文不

3、包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的作品成果,。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体。。均已在文中^^明确方式标明本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担L。)学位论文作者(需亲笔)签名:年月巧学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权南京农业大学可将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库,可W采用影印进行检索、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文。□。

4、保密,在本学位论文属于不保密年解密后适用本授权书""(请在上方框内打V)|^。学位论文作者(需亲笔)签名:&^年月巧导师(需亲笔>签名:办>皆年1扛月。日.呵)目录目录摘要IABSTRACTV符号与简略语说明防前5XI一部分文献综述第1一1第节参与污染物降解的转录调控因子分类简述1L民1.ys家族转录调控因子2.IdR家族转录调控因子3.R33Gnt家族转录调控因子4.AraC/XylS家族转录调控因子55.TetR家

5、族转录调控因子56.Mar艮家族转录调控因子67.XylR/Dmp民家族转录调控因子68.Crp/FN民家族转录调控因子8第二节参与污染物降解的Icl艮家族转录调控因子81PobR调控的模式9?/公公C的模式2PcaR调控pea/和133Mhp民调控W片如公C77巧r的模式144HmgR调控AwgyiCC|1勺模式155Iph民调控皆片公0的模式1642^公^716ThR控/片&7pii调公^//如//"的模式7GenR调控各en

6、OFM和gen衍/的模式178BlcR调控公C的模式18第王节有机污染物降解与分解代谢物阻遏效应191PTS介导分解代谢物阻遏192有机化合物降解中的分解代谢物阻遇222'122.Aew/owon幻spW施中苯甲酸及甲苯代谢的CC艮调控’HA2.2i?片0沈)coccMWo加7R1W及?/?片0航COCCWsp.TFB中的CC艮调控.23’’-2.3口c/wMW各/Mtowzcwn中3哲基苯甲酸/龙胆酸途径的CC民调控243-PBA的24第四节细

7、茵降解研究进展13-苯氧基苯甲酸樹生物分解代谢的调控机制研巧第二部分实验部分27’’T一-第章菌株成WnoWwmaeJ-g/nwertxzZl中3PBA双加氧酶基因簇转录激活因子Pba民的鉴定27一42公第节基因心L化及;?6£杞的转录分析271材料与方法271.1试剂与培养基271.2所用菌株与引物281.3细菌总DNA的提取281.4总RNA的提取291.5(PrimerExtensi)弓29I物延伸实验on1.7A2公6;?6a^转录

8、单位的确认301.7生物信息学分析312实验结果312.1抑)公^及如)幻C基因(簇)的转录起始位点312.2/76o4L42公基因簇的确认322.3启动子特征序列的预测32第二节;?6〇/1/^2公基因簇启动子区域结合蛋白的鉴定331材料与方法331.1试剂与培养基

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