钦州市hiv-1流行状况及亚型分析

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1、分类号：Ｒ学校代码：１０６０１密级：公开编号；Ｙ１２００２１０１ＧＵＩＬＩＮＭＥＤＩＣ乂ＬＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ硕±学位论文Ｈ－钦州市ＩＶ１流行状况及亚型分析Ｉ学科专业：内科学研究方向：重大传染病与分子生物学研究生姓名：张帅学号：Ｙ１２００２１０１学位类型：科学学位导师姓名：蒋就喜教授二０－五年六月独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工。作及取得的研究成果据我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，也，论文中不包含其他人已经发表或

2、撰写过的研究成果不包含未获得（巧：如恐有其化需要特别声明的，本栏可巧）或其他教育机－构的学位或证书使用过的材料■。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字曰期：２〇１５年６月〇曰少中｜学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解桂林医学院有关保留、使用学位论文的规定，，有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘允许论文被查閒和借阅。本人授权桂林医学院可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索、缩印或扫描等，可Ｗ采

3、用影印复制手段保存、汇编学位论文。同时授权中国学术期刊（光盘版）电子杂志社、《中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到中国优秀、国文全文数据库》，并通博硕±学位论文全文数据库》《中学位论过网络公众提供信服。（保密论文在解密后适用本向社会息务的学位）授权书论作者签：导师签字学位文名旅帅签曰：月０曰月巧字期签狎６巧］藝／韦是目录钦州市HIV-1流行状况及亚型分析…………………………………....1中文摘要……………………………………………………...................1ABSTRACT

4、……………………………………………………………...4英汉缩略词对照表………………………………………………………7前言………………………………………………………………………8正文……………………………………………………………………..101材料与方法…………………………………………………………101.1研究对象………………………………………………………….101.2主要实验试剂及试剂盒………………………………………….101.3主要耗材………………………………………………………….101.4主要实验仪器…………………………………

5、………………….111.5主要软件和程序………………………………………………….111.6实验方法………………………………………………………….111.6.1血液样本采集后的处理………………………………………..111.6.2提取血浆病毒RNA……………………………………………...121.6.3逆转录/巢式PCR，扩增gag区基因片段…………………….131.6.4PCR扩增产物的电泳鉴定……………………………………...141.65亚型确定，系统树分析，基因离散率计算……………………..152结果……………………………………

6、……………………………172.1人口学及流行病学资料………………………………………….172.2样本扩增与测序情况…………………………………………….182.3亚型判定结果……………………………………………………182.4系统进化分析……………………………………………………203讨论………………………………………………………………...224结论………………………………………………………………...25参考文献……………………………………………………………….26附录（综述）………………………………………………………….29攻读

7、学位期间发表的学术论文目录………………………………….42致谢…………………………………………………………………….43钦州市HIV-1流行状况及亚型分析中文摘要目的:流行病学与分子生物学方法相结合,了解掌握钦州市HIV-1的流行状况及其亚型分布特征，为今后钦州乃至广西地区的HIV-1的防控工作提供资料和依据。方法:以调查问卷的形式收集50例钦州市HIV-1感染者的人口学及流行病学资料，每例感染者采集抗凝全血5-10毫升，提取血浆病毒RNA，用逆转录╱巢式PCR法扩增gag区核酸片段，对PCR扩增产物进行鉴定，将阳性扩增产物送北

8、京军事医学科学院微生物流行病研究所进行基因测序，用BioEdit、MEGA5.03软件、Distance程序及在线分析工具Genotyping对所测得序列进行裁剪、校正、比对、构建系统进化树和亚型分析。结果:1.本实验共收集血液样本50例，其人口学及流行病学特征