广西三城市hiv-1型流行毒株gag基因亚型分析

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1、分类号：民５１１学校代码；１０６０１密级：公开编号：￥１２００２０＾ＧＵＩＬＩＮＭＥＤＩＣＡＬＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ硕±学位论文Ｈ－广西王城市ＩＶ１型流行毒株鲜ｇ基因亚型分祈学科专业：内科学研究方向：病毒性疾病研究生姓名：孔衍琳１学号：Ｙ２００２０７５学位类型：科学学位导师姓名：蒋就喜教授二０—五年一月独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，论文，除了文中特别加１＾标注和致谢的地方外中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含未获得（注：如没有其他需

2、要特别声明的，本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字曰期；（月。曰〇拌劫病《化２［／学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解桂林医学院有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权桂林医学院可Ｗ将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索、缩印或扫描等复制手段保存、汇编，可采用影印学位论文。同时授权中国学术期刊（光盘版）电子杂志社、中国科学技术信息研究所将本

3、学位论文收录到《中国优秀博硕±学位论文全文数据库》、《中国学位论文全文数据库》，并通过网络向社会公众提供信息服务。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名；导师签字：签字日期參＞／广年６月＾曰签字曰期：＞／许也月ｒ。曰分目录广西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亚型分析……………………………1中文摘要………………………………………………………………1ABSTRACT……………………………………………………………3英汉缩略词对照表……………………………………………………………6前言…………………………………………………………………….7正文…………

4、…………………………………………………………121实验材料...……………………………………………………….121.1研究对象……………………………………………………………….....101.2主要实验仪器………………………………………………....121.3主要实验试剂…………………………………………………121.4主要耗材………………………………………………………..141.5相关软件………………………………………………………..142实验方法………………………………………………………………….142.1提取血浆病毒RNA…………………………………………………….142.2逆转录

5、/巢式PCR（RT/Nest-PCR）………………………………….152.3序列分析……………………………………………………………..183结果………………………………………………………………………...193.1gag区电泳图………………………………………………………..193.2流行病学调查结果…………………………………………………193.3基因分析结果………………………………………………………..204结论…………………………………………………………………...……23参考文献………………………………………………………………..25附录（综述）……………………………………………

6、……………………...29攻读学位期间发表的学术论文目录………………………………………….38致谢…………………………………………………………………………….39II广西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亚型分析中文摘要目的了解广西2008年及以后确诊的HIV-1感染者流行病学及HIV-1亚型分布情况,从而进一步掌握广西最近的HIV-1流行毒株的分布规律、感染来源，并大体推测出其流行和蔓延规律，为广西艾滋病的预防控制策略的制定提供依据，甚至为全国的艾滋病预防控制工作的开展提供有价值的参考资料。方法分别在桂林、来宾、钦州采取样本100例、102例和103例，所有研究对象都经WB实验确

7、认为HIV-1感染者。对研究对象进行问卷调查、收集流行病学资料，包括病人基本信息（年龄、性别、职业、文化程度等）、有可能的感染途径、确诊时间、最近一次的病毒载量等；采集抗凝全血10mL、提取病毒RNA、用RT-PCR进行gag基因扩增并将阳性扩增产物送北京博迈德公司进行Sanger法测序，然后采用Bioedit、Simplot和MEGA5.05等相关生物学软件对所得序列进行序列的比对校正、亚型分析和系统进化分析。结果1.研究对象共305人，流行病学特征统计