猪瘟病毒分子流行病学研究及流行毒株全基因组序列分析

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1、学校代码：学号：分类号密级：綠去大營硕士学位论文题目：猪瘟病毒分子流行病学研究及流行毒株全基因组序列分析作者：黄耀华指导教师：杨雨辉教授专业：动物学时间：二〇一五年五月MolecularepidemiologicalstudiesofclassicalswinefevervirusandanalysisofthecompletegenomeofepidemicstrainsAThesisSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementFortheMaster

2、DegreeinScienceByHuangYao-huaSupervisor:YangYu-huiMajor:ZoologySubmittedtime:May,2015海南大学学位论文原创性声明和使用授权说明原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外’本论文不含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品或成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律结果由本人承担学位论文版权使用授权说明

3、本人完全了解海南大学关于收集、保存、使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。学校可以为存在馆际合作关系兄弟髙校用户提供文献传递班务和交换服务本人授权海南大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密论文在解密后遵守此规定。本人已经认真阅读“高校学位论文全文数据库发布章程”，同意将本人的学位论文提交高校学位论文全文数据库”中全文发布，并可按“章程”中规定享受相关权

4、益。同意论文提交后滞后：口半年：口一年：口二年发布。摘要猪瘟（，是由丨于黄病毒科（】搞病毒的猪德病毒弓丨发的猪的一种急性、发烧和接触件传染传染病。每年对我国养猪业造成人经济损失，被际兽疫防治局列为重大动物疫病。近些年来，全国范围内猪瘟兔化弱毒疫苗的使用有效地控制了猪瘟的大规模流行，但猪瘟在我国仍有散布流行，尚不能完全被消灭。一些学者认为，现在流行的毒株偏离弱毒疫苗株，是造成猪瘟疫苗对我国猪瘟病毐免疫保护作用有限的主要原因，也是疫苗免疫失败的一个重要瓰因。为了解我猪瘟病芾流行及遗传变异愔况，为有效地防

5、治猪瘟提供理论依据，本论文进行了如下内容的研究：基因遗传变异研究，采用方法，对年来自我国个省份的份猪瘟阳性病料屮的基因高变区的片段进行序列克降和测序，并对部分代表毒株的全基因进行克隆和测序，通过和软件利丨基因高变区的片段序列构建了株流行毒株的系统进化树对邰分具有代表性的毒株的全基因与参考毒株核苷酸及氨基酸的同源性进行比较，分析流行毒株蛋白的遗传变异情况。分离株和全基因组的研究：参考上已发表全基因序列，设计引物，通过成功的分段扩增了分离株和全基因组，并对两个分离株的同源性及细胞表位变异进行了分析。结果

6、表明：我国流行的仍然以亚群屮的类占绝对优势，但也出现了一些新的变化，一是以石门株为代表的亚群强毒株在我国町能已经消失，出现了新的类病毒，该类病毒于年后在我国流行的区域和流行强度有上升的趋势。类优势流行毒株和新出现的类毒株在某些重要的抗原表位位点和糖基化位点与临床上使用的猪瘟兔化疫苗存在差异，可能影响疫苗的免疫效果，也可能是目前非典型长期存在的原因。对年两株流行毒株和的全基因序列分析表明，测定和全长分别为和，是我国主要流行的类毒株，是我国新近分化出来的类毒株，为建立反向遗传操作平台打下基础。关键词：猪

7、瘟病毒；基因；分子流行病学AbstractClassicalswinefever(CSF)blongedtothegenusPestivirusinthefamilyFlaviviridaewhichwascausedbyclassicalswinefevervirus(CSFV).CSFVwasanacute,feverandcontactsexuallytransmittedinfectionsofpigs.CSFVhadcausedsignificanteconomiclossestoannu

8、alpigindustryandwasnotifiabledasamajoranimaldiseaseanimaldiseasesbytheOfficeIntertionaldesEpizooties(OIE).Inrecentyears,thenationwiderabbitattenuatedvaccinewasusedtocontroltheepidemicofCSFV,butCSFVwasnotcleanedup,whichstillwasprevalenti