猪瘟病毒广东流行毒株遗传分型及序列分析

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1、猪瘟病毒广东流行毒株遗传分型及序列分析中国动物检疫2011年第28卷第1O期——27——溺辩持人:胡藕祥zgdwjy@ina.c.m猪瘟病毒广东流行毒株遗传分型及序列分析李儒曙,苏惠龙,杨傲冰',禹思宇,黄岩,向华,张健腓.(1.珠海市动植物防疫监督检验中心,广东珠海519000;2.珠海出入境检验检疫局,广东珠海519000;3.广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室,广东广州510000)摘要:2006年至2009年期间,从广东省各地采集病,死猪的脾脏,淋巴结,或扁桃体,用RT-PCR的方

2、法扩增猪瘟病毒的E2全基因,用国际通用的进化分析软件对这6株病毒进行遗传分型,结果显示这6株猪瘟野毒均属于基因2.1亚群.推测广东省猪瘟病毒流行毒株目前主要以2.1亚群为主.关键词:猪瘟病毒;遗传分型;序列分析中图分类号:$852.651文献标识码:A文章编号:1005.944X(2011)10—0027.05G既懵TypingandSequ~c~AnalysisofClassicalSwin~FeverStrainsinG1埘l她ProvinceLiRushu,SuHuilong,YangAobing,Yu

3、Siyu,HuangYan,XiangHua3,ZhangJianfei(1.ZhuhaiAnimalandPlantEpidemicPreventionSupervisionandInspectionCenter,Zhuhai,Guangdong,519000;2.ZhuhaiExit—EntryInspectionandQuarantineBureau,Zhuhai,Guangdong,519000;3.TheVeterinaryResearchInstituteofGuangdongProvincial

4、AcademyofAgriculturalSciences,Guangzhou,Guangdong,51000)Ab—耐:GenetictypingandsequenceanalysiswereconductedbyusingthegeneralevolutionanalysissoftwareforE2completegeneofsixCSFVstrainscollectedbetween2006and2009invariouspartsofGuangdongProvince.Resultsshowedal

5、lthesixfieldCSFVstrainsbelongtoSubgroup2.1CSFVsuggestingthattheendemicCSFVstrainsinGuangdongwereSubgroup2.1inmain.Kw硼B:Classicalswinefevervires;Genetictyping;Sequenceanalysis猪瘟是由猪瘟病毒(CsFV)引起的一种高度接触性传染病,猪瘟对养猪业危害严重,可造成巨大损失,世界动物卫生组织(OIE)列为法定报告传染病.本病在国内大规模暴发基本停

6、止,但是在全国各地仍有不间断的散发.猪瘟的流行和发病特点近年来也已发生了很大变化,其流行形式已从频发的大流行转变为周期性,波浪形的地区性散发性流行,通常3~4年一个周期,疫点显着减少,多局限于所谓"猪瘟不稳定地区"散发性流行造成了巨大的经济损失[】].因此,猪瘟仍然是危害养猪业的头号大敌,在近年''高热病"肆虐的背景下,研究猪瘟的防制以及猪瘟病毒的遗传进化具有重大的经济和社会意义.猪瘟病毒遗传分型是追踪CSFV传播,变异以及持续性感染等极为有效的方法,CSFV的E2基因是国际上通用的用来进行猪瘟病毒遗传分型的

7、区域之一[2-31.对现存市面上的猪瘟活疫苗毒株和流行于广东省内的猪瘟野毒株E2基因进行序列测定,遗传分基金项目:广东省自然科学基金(NO.07019474);广东省农业攻关项目(NO.2007A020300005.9);广东省农业攻关项目(NO.2009A020101006).通讯作者:张健腓型和比较分析,进而找出各毒株之间主要抗原结构差异与免疫保护的相关性,为控制猪瘟提供理论基础.1材料与方法'1.1病料样品猪瘟阳性可疑病料(组织21份,血清50份)于2006--2009年采自广东省内,由广东永顺生物制药

8、有限公司技术服务部,佛山科技学院,广东省农业科学院兽医研究所猪病研究室和华南农业大学兽医学院传染病实验室提供.疫苗毒株为市面上购买的不同厂家产品.1.2主要试剂,质粒载体及引物提取总RNA所用裂解液Trizol为Invitrogen公司产品;cDNA第一链合成试剂盒,PCR试剂盒,质粒载体pMD18.T,DNAMarkerDL2000均为宝生物工程(大连)有限公司产品;E.coliDH5n工程菌为北

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