小鼠与牛在精子形成过程中

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1、小鼠与牛在精子形成过程中同源差异基因比对分析DifferentiallyexpressedhomologousgenesbetweenmouseandcattleduringthespermiogenesG01组员：李欣岳静伟潘建飞孙丹丹目录1、本组组员研究课题简介2、研究背景3、研究目的4、材料和方法5、实验进展6、下阶段工作任务1.本组组员研究课题简介潘建飞：题目：利用CRISPR/Cas9技术构建的UCP1定点敲入猪腹股沟脂肪组织转录组分析背景:1.哺乳动物主要存在两种脂肪：WHA和BAT。2.BAT通过UCP1来消耗能量来维持体温和抵抗肥胖，但是家猪

2、缺乏UCP1基因，导致新生仔猪不耐寒，给生产带来了巨大的困难。内容:利用CRISPR/Cas9构建了UCP1基因定点敲入猪，实现了UCP1基因在猪白色脂肪组织的特异表达。结果:UCP1猪在急性冷刺激情况下的体温维持能力显著优于野生型猪。生长性能测定结果显示UCP1基因敲入猪脂肪率显著降低，背膘厚度显著降低，瘦肉率显著上升。目的:UCP1作用的分子机制尚不清楚，通过猪腹股沟脂肪组织转录组分析来阐明！1.本组组员研究课题简介孙丹丹：题目：叶酸缺乏影响骨骼肌发育的分子机制背景:叶酸是人体必需的微量元素，体内不能合成，当摄入量不能满足需要时，引起很多健康问题。叶酸缺

3、乏影响骨骼肌发育的分子机制尚不清楚。目的:叶酸缺乏对骨骼肌肌细胞生成和增殖抑制的分子机制。岳静伟：课题尚未确定2、研究背景顶体颗粒顶体囊泡顶体线粒体鞘线粒体胞质残余体鞭毛中心粒精子形成过程2、研究背景3、研究目的1、寻找小鼠和牛的精子变形过程中四个阶段的同源基因2、寻找牛精子变形过程中同源基因中四个阶段的差异基因3、寻找小鼠精子变形过程中同源基因中四个阶段的差异基因4材料和方法•实验材料：•方法：单细胞转录组测序•测序平台：IlluminaHiSeq4000测序平台，技术路线流程图5已取得的实验进展•5.1小鼠数据的收集•YingZ,ChongT,TianY

4、,etal.MicroRNAscontrolmRNAfatebycompartmentalizationbasedon3′UTRlengthinmalegermcells[J].GenomeBiology,2017,18(1):105.•SRR3395024，SRR3395025，SRR3395026，SRR3395033，SRR3395034，SRR3395035，SRR3395030，SRR3395031，SRR3395032，SRR3395039，SRR3395040，SRR33950415已取得的实验进展•5.1小鼠数据收集•K,SinghA,Ngu

5、yenT,etal.TSPAN8ExpressionDistinguishesSpermatogonialStemCellsinthePrepubertalMouseTestis1[J].BiologyofReproduction,2016,95(6):117.•SRR3662178，SRR3662179，SRR3662181•LiX,AoJ,WuJ.SystematicidentificationandcomparisonofexpressedprofilesoflncRNAsandcircRNAswithassociatedco-expressionan

6、dceRNAnetworksinmousegermlinestemcells:[J].Oncotarget,2017,8(16):26573-26590.•SRR4413830，SRR4413831，SRR4413832SRA号测序方法文库类型样品类型小鼠品系SRR4423201SRR4423202IlluminaHiSeq4000Strand-specificMatureSpermC57BL/6JSRR4423203SRR4423204SRR3395024SRR3395025elongatingpolysomeSRR3395026SRR3395033SRR

7、3395034elongatingrnpTruSeqStrandedTotalSRR3395035IlluminaRNAC57BL/6JSRR3395030Hi-Seq2000LibrarySRR3395031roundpolysomeSRR3395032SRR3395039SRR3395040roundrnpSRR3395041SRR3662178SRR3662179IlluminaHiSeq2500Smart-seqSSCsC57BL/6JSRR3662181SRR4413830C57BL/6JSRR4413831IlluminaHiSeq2000Fir

8、st--strandcDNASSCsdx4-CreS