利用gateway克隆技术构建丹参smnac1转录因子rnai表达载体

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1、利用Gateway克隆技术构建丹参SmNACl转录因子RNAi表达载体[摘要]NAC转录因子参与植物生长发育和对生物和非生物胁迫的应答反应,利用Gateway克隆技术构建丹参NAC转录因子的RNAi植物表达载体,以便进一步研究丹参NAC转录因子的功能。根据Gateway技术要求,设计含有attB接头的引物,使用NEB的Phusion超保真聚合酶,通过PCR方法,扩增SmNAC1基因的特异性片段。通过BP重组反应,将带有attB接头的PCR产物克隆到入门载体pENTR/SD/D-TOPO±,再通过L

2、R重组反应,利用入门载体上的SmNACi特异性基因片断克隆到植物表达载体pK7GWIWG2D上。实验结果表明Gateway载体的构建方法能够高效、快速地将目的基因克隆到表达载体上,为植物基因转化提供基础。[关键词]RNAi;Gateway载体;BP和LR反应Gateway克隆技术是由invitrogen公司开发,基于入噬菌体的位点特异性重组原理[1-2],可以使DNA片段在不同的克隆载体之间实现转移,并保持基因定位和阅读框架不发生改变。入噬菌体的位点特异性重组是在噬菌体和细菌的整合因子(INF,I

3、nt)的作用下,入噬菌体的attP位点和大肠杆菌基因组的attB位点可以发生定点重组,入噬菌体DNA整合到大肠杆菌的基因组DNA中,两侧产生2个新位点:attL,attRo这是一个可逆的过程,在噬菌体编码蛋白Xis和细菌的整合因子IHF,Int的共同介导下这两个新位点可以再次重组回复为attB,attP位点。这一过程受编码蛋白Xis和整合因子(IHF,Int)调控。与经典基因克隆多个步骤相比,Gateway技术不用依赖限制性内切酶,而靠载体上存在的特定重组位点和重组酶,高效、快速地将目的基因克隆到

4、表达载体(destinationvector,目的载体)上,该方法只需一步生化反应便能达到目的,是高通量克隆基因的好方法。Gateway技术可以在任何选择的系统:细菌、酵母、昆虫或哺乳动物等[3-7]进行基因的功能表达分析。现在的多点Gateway技术[8],能够将一个或多个基因克隆到蛋白表达载体,这项强大的体外重组技术大大地简化了基因克隆和亚克隆的步骤,且同时克隆效率高达95%或更高。当基因在重组目的表达载体之间快速简便的穿梭时,还可以保证正确的方向和阅读框,同时,Gateway也有助于进行带有

5、不同标签蛋白的表达和纯化,见图loNAC是高等植物中特有的一类转录因子,自20世纪90年代从矮牵牛分离第1个NAC基因后[9]。拟南芥中已发现109个NAC转录因子,水稻中有75个NAC[10]oNAC蛋白根据N端保守序将NAC蛋白分为两大类(I,II),各包含14和4个亚类[ll]oNAC转录因子参与植物生长发育的调控,如花器官的发育、侧根的形成、木质部次生壁的形成以及叶片衰老等,同时NAC还参与生物胁迫和非生物胁迫。本项工作设计带有attB位点(CACC)的引物,利用PCR扩增目的基因SmNA

6、C1片断,以pENTR/SD/D-TOPO为入门载体,进行BP重组反应,形成带有目的基因片断的入门载体,经PCR检测,测序鉴定正确后,在LRClonase酶作用下,将BP重组反应的克隆产物与表达载体pK7GWIWG2D,进行LR重组反应,最终得到含目的基因SmNAC1的RNAi植物表达载体。通过使用Gateway技术,简单、快捷、准确的构建成功丹参转录因子SmNAC1的RNAi表达载体。1材料丹参Salviam订tiorrhizaBunge植株;pENTRDirectionalTOPOClonin

7、gKits,GatewayLRClonaseIIEnzymeMix,Gateway载体pK7GWIWG2D均购于Invitrogen公司;大肠杆菌EscherichiacoliDH5a感受态购自北京全式金生物技术有限公司;Phusion超保真聚合酶购自NEB公司;质粒提取试剂盒购自上海生工生物公司;ExTaq酶购自大连宝生物工程有限公司;卡那霉素、壮观霉素购自Amresco公司;所用引物均由生工生物工程(上海)有限公司合成。2方法2.ISmNACI基因RNAi片段的PCR扩增利用DNAman软件设

8、计NAC基因的特异性RNAi片段,根据Gateway载体构建的要求,引物5’末端要加上CACC,NACi-F:CACCATTTTCTCGAATTGAATGATTTGGGCCC;NACi-R:CTGATTTGTGTGTGCCTCGGTTACG□使用Phusion超保真酶PCR扩增反应程序:98£预变性30s,然后进行35个循环:98°C30s,57°C30s,72°C30s,循环结束后72°C10min延伸反应,4°C保温。1%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。2.2BP重组反应将PC

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