沙田柚f―box蛋白基因的克隆及序列分析

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1、沙田柚F―box蛋白基因的克隆及序列分析　　摘要：采用生物信息学方法，对沙田柚[Citrusmaxima（Burm.）Merr.cv.ShatianYu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明，该基因全长为1427bp（GenBank登录号为KR363148），开放阅读框（ORF）全长为1101bp，共编码366个氨基酸，编码蛋白质的分子质量43.09ku，理论等电点5.15。沙田柚F-box蛋白基因编码蛋白含有一个植物F-box蛋白家族的保守结构域，为亲水性

2、非分泌不稳定蛋白，不跨膜运动，共有30个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明，其编码的氨基酸与甜橙（Citrussinensis，KDO71185）和克莱门柚（Citrusclementina，XP_006425495）F-box蛋白的同源性分别为99%、98%。系统进化树表明，沙田柚F-box蛋白基因与与甜橙（Citrussinensis，KDO71185）和克莱门柚（Citrusclementina，XP_006425495）亲缘关系很近，属于同一进化分支。　　关键词：沙田柚[Citrusmaxima（Burm.）Merr.cv.

3、ShatianYu.]；F-box蛋白基因；序列分析　　中图分类号：S576文献标识码：A文章编号：0439-8114（2016）14-3723-04　　DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.14.046　　Abstract：ThecharactersoftheF-boxproteinofCitrus11maxima（Burm.）Merr.cv.ShatianYu.wereanalyzedandpredictedbybioinformaticsmethod，includingthecomposi

4、tionofaminoacidsequence，physicochemicalparameters，hydrophobicity，transmembranedomain，secondarystructureandfunctionofproteinetc.TheresultsshowedthattheF-boxgenewas1427bp（GenBankaccessionnumber：KR363148）inlengthwithanopenreadingframe（ORF）of1101bp，encoding366aminoacidswith

5、deducedmolecularweightof43.09ku，andtheoreticalpIvalueof5.15，andcontainedanF-boxdomaininNend.BioinformaticsanalysisshowedthattheF-boxproteinwasahydrophilicandunstableprotein，hasnotransmembranedomain，andthereare30phosphorylationsiteswithinthepolypeptidechain.Thehomologyan

6、alysisofaminoacidsequenceindicatedthattheF-boxproteinsharedhighhomologywiththatofCitrussinensis，KDO71185（99%）andCitrusclementina，XP_006425495（98%）.PhylogeneticanalysisrevealedtheF-boxproteingeneshowedcloserkinshipwiththatofCitrussinensisandCitrusclementina，indicatingtha

7、ttheybelongtothesameevolutionarybranch.　　Keywords：Citrusmaxima（Burm.）Merr.cv.ShatianYu.；F-boxproteingene；sequenceanalysis　　自交不亲和是植物界的一种普遍现象，根据其遗传背景可分为孢子体自交不亲和（Sporophytic11self-incompatibility，SSI）和配子体自交不亲和（Gemetophyticself-incompatibility，GSI）两种类型。植物自交不亲和性在被子植物的有性生殖中起到

8、避免近亲繁殖的重要作用[1]，阐明自交不亲和的分子机理在培育无子品种等方面具有重要的意义。近年来，蔷薇科（Rosaseae）、茄科（Solanaseae）、玄参科（Scrophulariaceae）等自交不亲和的研究取得