红笛鲷α-珠蛋白和β-珠蛋白基因的克隆及序列分析.pdf

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1、第31卷第3期广东海洋大学学报V01．31No．32011年6月JournalofGuangdongOceanUniversityJun．2011红笛鲷Q．珠蛋白和13．珠蛋白基因的克隆及序列分析张新中，鲁义善，吴灶和，简纪常(广东海洋大学水产学院，广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室暨广东省高等学校水产经济动物病害控制重点实验室，广东湛江524025)摘要：应用已知的标签序列通过RACE．PCR和RT-PCR方法成功克隆红笛鲷(Lu和lqUSsanguineus)洳珠蛋白和p-珠蛋白基因的全长eDNA序

2、列。a．珠蛋白和B．珠蛋白基因的cDNA全长分别为560和563bp，开放阅读框分别为429和444bp，各编码143和148个氨基酸，理论相对分子质量分别为15690和16400，理论等电点为7．79和6．61。氨基酸序列BLAST结果表明，红笛鲷a．珠蛋白基因和D．珠蛋白基因编码的氨基酸序列与其他鱼类的相似性分别在59％～79％和55％～80％之间。用邻接法(Neighbor-Joining)构建的c【．珠蛋白基因和D一珠蛋白基因的系统发育树表明，红笛鲷与真鲷(Pagrusmajor)、金头鲷(Sparusaur

3、ata)和蛳(Seriolaquinqueradiata)等亲缘关系较近。关键词：红笛鲷；仪．珠蛋白；B．珠蛋白；基因克隆；基因序列中图分类号：Q959．483．3+Q75文献标志码：A文章编号：1673-9159(2011)03-0001-06MolecularCloningandSequenceAnalysisofa—and[I-GlobinGeneofHunpheadSnapper伍“咖nussanguineus)ZHANGXin-zhong，LUYi-shan，、^，UZao-he，JIANJi·chang(

4、FisheriesCollegeofGuangdongOceanUniversity，GuangdongProvincialKeyLaboratoryofPathogenicBiologyandEpidemiologyforAquaticEconomicAnimals＆KeyLaboratoryofDiseasesControllingfo，．AquaticEconomicAnimalsofGuangdongHigherEducationInstitutions，Zhanjiang524025，China)Abstr

5、act：Full—lengthcDNAsequenceofu-globinand13-globingeneofhumpheadsnapper(Lutjanussanguineus)wereclonedbyRACE-PCRandRT-PCRmethodfromtheknownESTs．Thelengthofa-globinandp-globingeneare560bpand563bprespectively．Theopenreadingframeof0【一globinandp-globingenecontain429b

6、pand444bprespectively，andencode143and148aminoacidsrespectively．Relativemolecularweightofa-globinand13-globinare15690and16400．Thetheoreticalisoelectricpointofthemare7．79and6．61．respectively．Resultsofaminoacidsequenceanalysisshowthatthesimilarityofa-globinandp-gl

7、obingeneofhumpheadsnappercomparedwithotherfishareintherangeof59％一79％and55％一80％respectivelyPhylogenetictreeofa—globinandp-globingenearebuiltbyneighbor-joiningmethodandtheresultsalsoshowthathumpheadsnapperhastheclosesthomologywithPagrusmajor，SparusaurataandSeriol

8、aquinqueradiata．Keywords：Lu驷nussanguineus；a—globingene；13-globingene；clone血红蛋白由两个仅类和两个B类珠蛋白链构成，每个珠蛋白链均结合一个血红素。目前，珠蛋白在多种脊椎动物基因调控和生物学进化研究方面已成为一种模式蛋白，有关鲤(Cyprinuscarpio)、收稿日期：2